| 用生物信息学方法发现跨染色体剪接的嵌合5′/3′UTRs |
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| 引用本文： | 张治华,张勇,石宝晨,邓巍,赵屹,陈润生.用生物信息学方法发现跨染色体剪接的嵌合5′/3′UTRs[J].科学通报,2004,49(8):755-758. |
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| 作者姓名： | 张治华 张勇 石宝晨 邓巍 赵屹 陈润生 |
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| 作者单位： | 1. 中国科学院生物物理研究所,北京,100101
2. 中国科学院计算技术研究所,北京,100080
3. 中国科学院生物物理研究所,北京,100101;中国科学院计算技术研究所,北京,100080 |
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| 基金项目： | 本工作为国家重点基础研究发展规划(批准号: 2003CB715907)和中国科学院知识创新工程(批准号: KSCX2-2-07)资助项目. |
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| 摘 要： | mRNA的5′/3′ UTRs是在mRNA翻译过程中起重要调控作用的序列, 在5′/3′ UTRs上不正常的剪接模式可能导致多种严重疾病. 提出了一种基于大规模序列比对分析搜寻5′/3′ UTRs跨染色体剪接现象的方法, 并用此方法得到8例可信度高的跨染色体的5′/3′UTRs剪接事件, 从信息的角度证实了来自不同染色体序列剪接成为5′/3′ UTRs的现象是真实存在的. 对这8例跨染色体剪接产生的5′/3′ UTRs用多序列比对在剪接区域没有发现一致保守的motif. 同时, 目前的预测算法也不能在剪接区域检测到特异性的RNA二级结构, 因此很难确定引导5′/3′ UTRs跨染色体剪接的信号.
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| 关 键 词： | 5′/3′ UTRs mRNA 反式剪接 染色体易位 嵌合 |
| 收稿时间： | 2003-12-15 |
| 修稿时间： | 2004-03-15 |
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