基于化学键偶极的精氨酸分子力场参数的建立 |
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作者姓名: | 刘琦 祝佳怡 姜笑楠 孙长亮 郝强 王长生 |
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作者单位: | 1. 辽宁师范大学化学化工学院;2. 沈阳化工大学分析测试中心 |
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摘 要: | 探讨了一种新的诱导化学键偶极计算方法并确定了相关参数,并将其应用于计算质子化精氨酸侧链或质子化精氨酸片段与水分子形成的团簇的二体和三体相互作用能.通过与已有的AMOEBAbio18方法进行比较,发现新方法在预测团簇相对稳定性方面表现出了良好的性能,且在计算效率上具有明显优势.此外,该方法在其他随机团簇的相互作用能计算中也展现了令人满意的准确度.总的来说,本研究为分子模拟和计算化学领域提供了一种可靠的计算方法,有望在药物设计和生物化学研究中具有广泛的应用前景.
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关 键 词: | 精氨酸 质子化 分子力场 化学键偶极 |
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