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基于Markov模型的基因组合调控模块预测
引用本文:李慧敏,石玉,杨志刚,江绍萍. 基于Markov模型的基因组合调控模块预测[J]. 云南民族大学学报(自然科学版), 2013, 22(2): 115-118,135
作者姓名:李慧敏  石玉  杨志刚  江绍萍
作者单位:1. 云南民族大学数学与计算机科学学院,云南昆明,650031
2. 郑州师范学院数学系,河南郑州,450044
3. 四川大学计算机学院,四川成都,610065
基金项目:云南民族大学青年基金,郑州师范学院培育基金
摘    要:研究了Markov模型在预测基因组合调控模式中的应用.首先基于基因序列特点构造Markov模型,并发展了预测基因组合调控模块的概率模型.然后结合目前基因组合调控模式数据库的特征,提出了比较模型优劣的新指标:丰度.最后利用提出的模型预测分析酵母核糖体蛋白基因中的转录调控模块,并与其它方法进行比较,结果表明Markov模型在预测基因组合调控模式时的有效性和优越性.

关 键 词:基因  组合调控  模块  Markov模型  模型比较

Prediction of combinatorial regulatory modules of genes based on the Markov model
LI Hui-min , SHI Yu , YANG Zhi-gang , JIANG Shao-ping. Prediction of combinatorial regulatory modules of genes based on the Markov model[J]. Journal of Yunnan Nationalities University:Natural Sciences Edition, 2013, 22(2): 115-118,135
Authors:LI Hui-min    SHI Yu    YANG Zhi-gang    JIANG Shao-ping
Affiliation:1(1.School of Mathematics and Computer Science,Yunnan University of Nationalities,Kunming 650031,China; 2.Department of Mathematics,Zhengzhou Normal University,Zhengzhou 450044,China; 3.College of Computer Science,Sichuan University,Chengdu 610065,China)
Abstract:
Keywords:
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