| 回交、DH和RIL偏分离群体遗传图谱的重新构建 |
| |
| 引用本文： | 朱成松,王付华,王建飞,李广军,张红生,章元明.回交、DH和RIL偏分离群体遗传图谱的重新构建[J].科学通报,2007,52(8):918-922. |
| |
| 作者姓名： | 朱成松 王付华 王建飞 李广军 张红生 章元明 |
| |
| 作者单位： | 南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室,南京,210095 |
| |
| 基金项目： | 国家重点基础研究发展计划（批准号：2006CB101708）、国家自然科学基金（批准号：30470998,30671333）、江苏省自然科学基金（批准号：BK2005087）、教育部“长江学者和创新团队发展计划”和新世纪优秀人才支持计划（批准号：NCET-05-0489）、国家高技术研究发展计划（批准号：2006AA1021E5）、教育部与人事部留学回国人员基金和南京农业大学人才基金资助项目,致谢：感谢特邀编辑和审稿人为本文提出的建设性意见与评论. |
| |
| 摘 要： | 分子标记偏离孟德尔分离比例(称偏分离)是一种普遍的生物学现象. 虽然偏分离可能会影响标记间遗传距离的估计值和数量性状基因座(quantitative trait locus, QTL)定位结果, 但在遗传连锁图构建和QTL定位中偏分离的影响常常被忽视. 在分子标记存在偏分离、显性和缺失情况下, 根据隐马尔可夫模型, 我们已发展了一种新的多点方法来重新构建F2群体分子标记连锁图, 以解决偏分离对标记连锁图构建的影响. 本文简化了上述方法以适用于回交、加倍单倍体和重组自交系群体. 模拟研究表明: (ⅰ) 两连锁偏分离基因座(segregation distortion locus, SDL)影响标记间遗传距离的程度随SDL遗传率和标记间遗传距离的增加而增加, 但受样本容量的影响较小; (ⅱ) 两连锁SDL一般会低估标记间遗传距离, 但是, 加性模型下两个SDL加性效应符号相反时会高估之, 上位性模型下两SDL加性×加性效应为负时却不影响其估计; (ⅲ) 用本文的方法均能矫正遗传距离估计值的偏差. 将新发展的方法应用于已构建的一个存在严重偏分离的水稻(Oryza sativa L.)籼粳杂交组合IR28×大关稻的F7代重组自交系群体, 重新构建了分子标记遗传图谱, 并用Bootstrap法获得了遗传距离的95%置信区间. 这些结果进一步印证了本文发展的新方法. 这为数量性状和生活力性状的遗传分析提供了基础. 为实际数据分析研制的DistortedMap计算机软件可供利用.
|
| 关 键 词： | 分离群体 偏分离 遗传图谱 生活力选择 EM算法 |
| 收稿时间： | 2006-12-29 |
| 修稿时间： | 2006-12-292007-03-29 |
| 本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《科学通报》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《科学通报》下载免费的PDF全文 |
|
