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利用转录组数据鉴定青海钩虾细胞色素P450家族成员
引用本文:郑志琴,陈棋昌,刘丹,章昭,晁燕,祁得林.利用转录组数据鉴定青海钩虾细胞色素P450家族成员[J].青海大学学报,2020,38(2).
作者姓名:郑志琴  陈棋昌  刘丹  章昭  晁燕  祁得林
作者单位:省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室,青海大学,青海 西宁 810016;青海大学农牧学院,青海 西宁 810016;省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室,青海大学,青海 西宁 810016;青海大学生态环境工程学院,青海 西宁 8100161;省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室,青海大学,青海 西宁 810016;青海大学农牧学院,青海 西宁 810016
摘    要:淡水钩虾是重要的环境指示生物,尤其是细胞色素P450家族成员的表达可作为早期预警的生物标记。为了鉴定青海钩虾细胞色素P450家族成员,采用Illumina Hiseq~(TM) 2500高通量测序技术对青海钩虾转录组进行测序,并对P450家族成员进行分析鉴定。结果表明:青海钩虾中共获得了273 507个转录本,总长为167 791 835 bp,隶属于233 462个unigene,大小为137 818 327 bp。从转录本中鉴定到青海钩虾14个细胞色素P450家族成员,大部分基因均获得了全长序列60%以上的片段。

关 键 词:高通量测序  青海钩虾  转录组  细胞色素P450
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