利用转录组数据鉴定青海钩虾细胞色素P450家族成员 |
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引用本文: | 郑志琴,陈棋昌,刘丹,章昭,晁燕,祁得林.利用转录组数据鉴定青海钩虾细胞色素P450家族成员[J].青海大学学报,2020,38(2). |
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作者姓名: | 郑志琴 陈棋昌 刘丹 章昭 晁燕 祁得林 |
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作者单位: | 省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室,青海大学,青海 西宁 810016;青海大学农牧学院,青海 西宁 810016;省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室,青海大学,青海 西宁 810016;青海大学生态环境工程学院,青海 西宁 8100161;省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室,青海大学,青海 西宁 810016;青海大学农牧学院,青海 西宁 810016 |
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摘 要: | 淡水钩虾是重要的环境指示生物,尤其是细胞色素P450家族成员的表达可作为早期预警的生物标记。为了鉴定青海钩虾细胞色素P450家族成员,采用Illumina Hiseq~(TM) 2500高通量测序技术对青海钩虾转录组进行测序,并对P450家族成员进行分析鉴定。结果表明:青海钩虾中共获得了273 507个转录本,总长为167 791 835 bp,隶属于233 462个unigene,大小为137 818 327 bp。从转录本中鉴定到青海钩虾14个细胞色素P450家族成员,大部分基因均获得了全长序列60%以上的片段。
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关 键 词: | 高通量测序 青海钩虾 转录组 细胞色素P450 |
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