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自组装DNA链置换分子逻辑计算模型
引用本文:张成,马丽娜,董亚非,杨静,许进.自组装DNA链置换分子逻辑计算模型[J].科学通报,2012(31):2909-2915.
作者姓名:张成  马丽娜  董亚非  杨静  许进
作者单位:北京大学信息科学技术学院,高可信度软件技术教育部重点实验室;陕西师范大学生命科学学院;华北电力大学控制与计算机工程学院
基金项目:国家自然科学基金重大仪器专项(61127005);国家自然科学基金重点项目(61133010,61033003);国家自然科学基金国际重大合作项目(60910002);国家自然科学基金面上项目(61143003);教育部博士点基金(20110001130016);中国博士后特别资助项目(201104018);博士后基金(20100480128,2011M500197)资助
摘    要:将DNA自组装与链置换技术相结合,构建了DNA分子逻辑计算模型.通过输入DNA信号链,经特异性识别和链置换,自组装初始结构发生变化,并释放特定信号分子或结构作为输出.计算模型能通过DNA自组装结构电泳迁移率的改变输出计算结果.计算系统在室温下可自动触发、混合输入信号以及并行置换.另外,本模型中引入了单极和双极两种置换模式设计,其还具有并行信息处理和模块化组装等特点.最后经实验验证,通过输入特异性DNA分子链置换,该计算模型能正确输出逻辑计算结果.

关 键 词:DNA链置换  DNA自组装  分子逻辑计算  分子智能  模块化设计
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