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基于改进核模糊粗糙集的特征基因混合选择方法
引用本文:
陈 涛. 基于改进核模糊粗糙集的特征基因混合选择方法[J]. 中南民族大学学报(自然科学版), 2018, 0(2): 121-127
作者姓名:
陈 涛
作者单位:
陕西理工大学数学与计算机科学学院
基金项目:
国家自然科学基金资助项目(11502132) ; 陕西省教育厅科研资助项目(16JK1149) ; 陕西理工大学科研资助项目( SLGQD2017-07)
摘 要:
针对基因表达谱高维、小样本、高冗余和高噪声等特点,提出了一种特征基因混合选择方法.采用Relief F方法对原始基因进行排序,过滤无效基因,获得初选基因子集,给出了基于差分进化算法优化的核模糊粗糙集模型,进行了特征基因终选.仿真实验结果表明:所提算法比Relief F、Kruskal Wallis、Gini Index等算法在分类精度和基因数量等方面有明显优势.
关 键 词:
基因表达谱
特征基因选择
ReliefF 方法
核模糊粗糙集
差分进化算法
A Hybrid Feature Gene Selection Algorithm Based on an Improved Kernelized Fuzzy Rough Sets
Abstract:
Keywords:
gene expression profile
feature gene selection
ReliefF algorithm
kernelized fuzzy rough sets
differential evolution
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