| 微孢子虫感染的柞蚕蛹内细菌种群分布及遗传多样性分析 |
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| 引用本文： | 何承民 、何强 、张小燕. 微孢子虫感染的柞蚕蛹内细菌种群分布及遗传多样性分析[J]. 西南师范大学学报(自然科学版), 2016, 41(7) |
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| 作者姓名： | 何承民 、何强 、张小燕 |
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| 作者单位： | 重庆师范大学生命科学学院,重庆,400047 |
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| 基金项目： | 国家高技术研究发展计划“863”项目，重庆市教委科学技术项目(KJ090813，KJ110611)． |
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| 摘 要： | 分离纯化微孢子虫感染的柞蚕蛹内单细胞微生物,采用CTAB法提取混合样品总DNA,并应用高通量SOLEXA测序技术进行测序.通过生物信息学方法进行分析比较,共鉴定了87个种,隶属于37个属17个科的细菌,主要分布在变形杆菌属Proteus、乳球菌属Lactococcus、假单胞菌属Pseudomonas、芽孢杆菌属Bacillus、肠球菌属Enterococcus等,揭示了微孢子虫感染的柞蚕蛹内细菌种群的多样性.对细菌相关基因的COG(同源蛋白簇)注释显示,参与产能及能量代谢的基因数量所占比例最多;对蛋白序列遗传距离的分析显示,编码硫胺素、二硫键分子伴侣、NADH泛醌氧化还原酶NqrA亚基等的基因在细菌种群中遗传变异相对较大,说明在蛹环境中这些参与能量代谢的相关基因变异速度加快.研究感染微孢子的宿主体内细菌物种的多样性,对于进一步挖掘微孢子虫与细菌共寄生宿主过程中的相互作用具有潜在意义.
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| 关 键 词： | 柞蚕； 蛹； 细菌； 多样性； 基因组 |
On Diversity of Bacterial Population in Microsporidia-Effected Pupa of Chinese Oil Silkworm Antherea Pernyi |
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| HE Cheng-Min,HE Qiang,ZHANG Xiao-yan. On Diversity of Bacterial Population in Microsporidia-Effected Pupa of Chinese Oil Silkworm Antherea Pernyi[J]. Journal of southwest china normal university(natural science edition), 2016, 41(7) |
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| Authors: | HE Cheng-Min HE Qiang ZHANG Xiao-yan |
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