| 一种共调控基因聚类的新方法 |
| |
| 引用本文： | 白天,周春光,刘桂霞,王晗,王喆,张宏婷.一种共调控基因聚类的新方法[J].吉林大学学报(理学版),2009,47(2):292-298. |
| |
| 作者姓名： | 白天 周春光 刘桂霞 王晗 王喆 张宏婷 |
| |
| 作者单位： | 吉林大学 计算机科学与技术学院, 长春 130012 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金，国家高技术研究发展计划(863计划)，吉林大学面向21世纪教育振兴行动计划（985计划），欧盟项目TH/Asia Link/010，教育部符号计算与知识工程重点实验室项目 |
| |
| 摘 要： | 定义了一种基于滑动匹配的相似度, 并在此基础上提出一种能够自适应确定聚类数目的全局K-均值算法, 解决了现有共调控基因聚类方法无法考虑到基因的正反、 延时、 部分时间和差异表达全部4种共调控关系的问题. 将提出的算法应用于微阵列数据中, 并将实验结果与CLUSTER 3.0算法进行了比较, 验证了算法的可行性和有效性.
|
| 关 键 词： | 共调控基因 聚类 全局K-均值 相似度度量 |
| 收稿时间： | 2008-07-19 |
A Novel Approach to Clustering Co-regulated Gene |
| |
| BAI Tian,ZHOU Chun-guang,LIU Gui-xia,WANG Han,WANG Zhe,ZHANG Hong-ting.A Novel Approach to Clustering Co-regulated Gene[J].Journal of Jilin University: Sci Ed,2009,47(2):292-298. |
| |
| Authors: | BAI Tian ZHOU Chun-guang LIU Gui-xia WANG Han WANG Zhe ZHANG Hong-ting |
| |
| Institution: | College of Computer Science and Technology, Jilin University, Changchun 130012, China |
| |
| Abstract: | This paper presents a new method of similarity measurement,on the basis of which an global K-means algorithm is presented that is self-adaptive to the determination of the number of cluster,so as to solve the problem that the existing methods of co-regulated gene clustering can take into account all the four co-regulating relationships,that is,reverse,asynchronous,part-time,and differences in the expression.The present algorithm has been applied to the microarray data,and the compare experimental results wi... |
| |
| Keywords: | co-regulating gene clustering global K-means similarity measurement |
| 本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《吉林大学学报(理学版)》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《吉林大学学报(理学版)》下载免费的PDF全文 |
|
