卓奥友顶峰(8201 m)积雪中细菌菌群结构及多样性分析 |
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引用本文: | 童晓梅,陈芳,于军,华桑,阿叁次仁,洛桑江白,王威,梁羽,郑晓光,汪建.卓奥友顶峰(8201 m)积雪中细菌菌群结构及多样性分析[J].科学通报,2008,53(18):2216-2222. |
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作者姓名: | 童晓梅 陈芳 于军 华桑 阿叁次仁 洛桑江白 王威 梁羽 郑晓光 汪建 |
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作者单位: | 中国科学院北京基因组研究所 |
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基金项目: | 中国科学院知识创新工程重要方向性项目(批准号: KSCX2-SW-331)资助 |
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摘 要: | 通过对卓奥友顶峰(海拔8201 m)积雪中细菌的扫描电子显微镜观察和640条16S rRNA基因序列测序分析, 发现雪样中细菌含量丰富, 大部分细菌为球状或椭圆状(>95%). 细菌的分类包括柄杆菌属(Caulobacter)、青枯菌属(Ralstonia)、Cupriavidus属、Pelomonas属和假单胞菌属(Pseudomonas). 其中假单胞菌属(Pseudomonas)的细菌含量最为丰富, 占所有16S rRNA基因序列的91.25%, 为该样品中的优势物种. 通过系统进化树分析和数据比对, 卓奥友雪样中的细菌除了与其他冰川、海冰或者寒冷环境条件中的细菌具有高度同源外, 还与其他环境如海洋、湖水和土壤中分离出的细菌的16S rRNA基因序列间具有高度的同源性. 这说明, 一方面, 寒冷贫瘠的极端环境条件对细菌的生存具有明显的选择性作用, 只有耐寒或嗜冷的细菌才能在冰川的极端环境下生存下来; 另一方面, 雪样中的细菌与其他环境条件如海洋, 湖水和土壤中的细菌的起源是相同的.
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关 键 词: | 卓奥友 积雪 16S rRNA基因 系统进化 |
收稿时间: | 2008-05-05 |
修稿时间: | 2008-06-05 |
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