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盾叶薯蓣3-羟基,3-甲基戊二单酰辅酶A还原酶和环阿屯醇合成酶基因克隆及序列分析
引用本文:秦玉芝,邓克勤,林建中,刘选明. 盾叶薯蓣3-羟基,3-甲基戊二单酰辅酶A还原酶和环阿屯醇合成酶基因克隆及序列分析[J]. 湖南大学学报(自然科学版), 2007, 34(7): 61-66
作者姓名:秦玉芝  邓克勤  林建中  刘选明
作者单位:湖南大学,生命科学与生物技术研究院,湖南,长沙,410082;吉首大学,生物资源与环境科学学院,湖南,吉首,416000;湖南大学,生命科学与生物技术研究院,湖南,长沙,410082
基金项目:"985工程"创新平台资助项目
摘    要:根据已报道的植物3-羟基,3-甲基戊二单酰辅酶A还原酶(HMGR)和环阿屯醇合成酶(CS)基因保守序列分别合成简并引物,先后从盾叶薯蓣(Dioscorea zingiberensis)幼苗中克隆了一段663 bp(HMGR-DZh)和一段1 245 bp(CS-DZc)的cDNA片段,经NCBI和CLUSTALW在线序列同源分析,结果表明,由HMGR-DZhcDNA推导的蛋白质与已报道植物HMGR氨基酸序列相似性达到63%~70%.由CS-DZc cDNA推导的蛋白质氨基酸序列中具有环氧角鲨烯环化酶(OSCs)特异保守结构域:DCTAE结构域和C末端的2个QW高度保守区,并与已报道植物环阿屯合成酶氨基酸序列相似性达到80%以上.本实验还分别以HMGR-DZh和CS-DZccDNA为探针进行了Southern和Northern杂交分析.Northern杂交分析表明,盾叶薯蓣HMGR-DZh基因的mRNA约为1.8~2 kb,CS-DZc基因的mRNA约为2~2.5 kb.

关 键 词:序列同源分析  盾叶薯蓣  HMGR  CS  基因克隆  杂交
文章编号:1000-2472(2007)07-00061-06
修稿时间:2006-12-25

Cloning and Sequencing of HMGR and CS Gene of Dioscorea Zingiberensis
QIN Yu-zhi,DENG Ke-qin,LIN Jian-zhong,LIU Xuan-ming. Cloning and Sequencing of HMGR and CS Gene of Dioscorea Zingiberensis[J]. Journal of Hunan University(Naturnal Science), 2007, 34(7): 61-66
Authors:QIN Yu-zhi  DENG Ke-qin  LIN Jian-zhong  LIU Xuan-ming
Affiliation:1. Institute of Life Science and Bioteehnology,Hunan Univ,Changsha, Hunan 410082, China; 2. College of Biological Resources and Environmental Science, Jishou Univ, Jishou, Hunan 416000, China
Abstract:
Keywords:sequence alignment  Dioscorea zingiberensis  HMGR  CS  gene clone  blot
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