| 浙江近无柄雅榕古树叶绿体基因组特征分析 |
| |
| 引用本文： | 池 伟,池雷均,潘贺威,夏小李,黄振华.浙江近无柄雅榕古树叶绿体基因组特征分析[J].海南师范大学学报(自然科学版),2020,33(1):50-57. |
| |
| 作者姓名： | 池 伟 池雷均 潘贺威 夏小李 黄振华 |
| |
| 作者单位： | 瑞安市自然资源和规划局,浙江瑞安325200,瑞安市自然资源和规划局,浙江瑞安325200,瑞安市自然资源和规划局,浙江瑞安325200,瑞安市自然资源和规划局,浙江瑞安325200,浙江省海洋水产养殖研究所,浙江温州325005;浙江省近岸水域生物资源开发与保护重点实验室,浙江 温州 325005 |
| |
| 摘 要： | 以一株浙江近无柄雅榕古树为研究对象,通过Illumina HiSeq测序平台对其叶绿体基因组进行了测序,分析了其叶绿体基因组结构特征及其近缘种间关系。结果表明:近无柄雅榕叶绿体DNA全长160 292 bp,具有典型的环状结构,由4个区域组成,包括1个大单拷贝区(large single copy,LSC)、1个小单拷贝区(small single copy,SSC)和一对分开的反向重复区域(inverted repeat,IR),LSC、SSC、IR的长度分别为88 565、20 145和25 791 bp;共注释出118个基因,其中包括4个rRNA基因、31个tRNA基因和83个蛋白质编码基因;共检索到68个SSR,其中包括11个复合型SSR、52个单碱基重复、4个二碱基重复和1个三碱基重复;与蛋白质编码基因对应的密码子偏好使用A/T碱基,在所有密码子中编码亮氨酸(Leu)的密码子最多;在系统发育树上,近无柄雅榕与已报道的菩提树亲缘关系最近,同源性达99%以上。
|
| 关 键 词： | 近无柄雅榕 叶绿体基因组 特征分析 微卫星 系统发育 |
Characteristic Analysis of the Complete Chloroplast Genome of Ficus
concinna Miq. var. subsessilis Corner -An Ancient Tree from
Zhejiang Province, China |
| |
| CHI Wei,CHI Leijun,PAN Hewei,XIA Xiaoli,HUANG Zhenhu.Characteristic Analysis of the Complete Chloroplast Genome of Ficus
concinna Miq. var. subsessilis Corner -An Ancient Tree from
Zhejiang Province, China[J].Journal of Hainan Normal University:Natural Science,2020,33(1):50-57. |
| |
| Authors: | CHI Wei CHI Leijun PAN Hewei XIA Xiaoli HUANG Zhenhu |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | |
| 本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《海南师范大学学报(自然科学版)》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《海南师范大学学报(自然科学版)》下载免费的PDF全文 |
|
