| 基于必需基因数据库的微生物必需基因的分析 |
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| 引用本文： | 窦运涛.基于必需基因数据库的微生物必需基因的分析[J].天津理工大学学报,2006,22(2):9-13. |
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| 作者姓名： | 窦运涛 |
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| 作者单位： | 天津大学,物理系,天津,300072 |
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| 基金项目： | 国家重点基础研究发展计划(973计划) |
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| 摘 要： | 维持某种生物细胞生长所必需的基因被称为是这个物种的必需基因．这些基因组成了该物种生存所需要的最小基因集合．本文构建了必需基因数据库（DEG）以及探索必需基因数据库的可能应用，应用Z曲线方法分析了枯草杆菌（Bacillus subtilis）中必需基因和非必需基因的核苷酸分布，并且通过蛋白质序列比对的方法对大肠杆菌（E．coli K12）的必需基因进行理论预测，同时分析了大肠杆菌基因组当中必需基因的功能分类，探讨了通过序列比对的方法确定微生物必需基因的可行性．
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| 关 键 词： | 必需基因 必需基因数据库 Z曲线 序列比对 |
| 文章编号： | 1673-095X（2006）02-0009-05 |
| 收稿时间： | 2005-04-25 |
| 修稿时间： | 2005-04-25 |
Analysis of microbial essential genes based on database of essential genes ( DEG ) |
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| DOU Yun-tao.Analysis of microbial essential genes based on database of essential genes ( DEG )[J].Journal of Tianjin University of Technology,2006,22(2):9-13. |
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| Authors: | DOU Yun-tao |
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| Institution: | Department of Physics, Tianjin University, Tianjin 300072, China |
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| Abstract: | Essential genes are the genes that are indispensable to support cellular life.These genes constitute a minimal gene set required for a living cell.This paper constructs database of essential genes(DEG) and explores possible applications of DEG.The author analyzes the nucleotide distribution of essential genes and nonessential genes in Bacillus subtilis using the Z curve method and predicts the essential genes using the method of BLAST.Besides,the author categorizes the essential genes in E.coli K12 according to different functional groups and tries to discuss feasibility of predicting essential genes using the BLAST method. |
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| Keywords: | essential genes database of essential genes Z curve BLAST |
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