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深海沉积物中产淀粉酶细菌的rep-PCR基因指纹分析
引用本文:戴世鲲,郑天凌,郑伟,王晓颖.深海沉积物中产淀粉酶细菌的rep-PCR基因指纹分析[J].厦门大学学报(自然科学版),2005,44(Z1):171-174.
作者姓名:戴世鲲  郑天凌  郑伟  王晓颖
作者单位:1. 厦门大学生命科学学院,应用与环境微生物研究所
2. 厦门大学生命科学学院,应用与环境微生物研究所;近海海洋环境科学国家重点实验室(厦门大学),福建,厦门,361005
基金项目:国家重点基础研究发展规划项目"地球圈层相互作用中的深海过程和深海记录"子课题"深海生物圈在物质循环中的作用"(G2000078504),国家教育部高校优秀骨干教师资助项目
摘    要:利用淀粉酶筛选培养基平板从27个深海沉积物样品中筛选得到30个具有胞外淀粉酶活性的菌株.其中革兰氏阴性细菌有22株,阳性细菌有8株.对这些细菌的基因组DNA进行ERICPCR和BOXPCR扩增,指纹图谱显示大部分菌株均存在数目不等的各自独特的带型,各特异性扩增的主带型能重复稳定出现.比较两种引物的指纹图谱,显示ERICPCR比BOXPCR具有较丰富的图谱多态性.对产生的指纹图谱进行聚类学分析,30株细菌可分为10组,其中5株细菌分别独立成组,最多的第Ⅱ组包含有8株细菌,而在同一聚类组内的细菌可能是处于进化上亲缘关系较近的位置.研究显示,30株菌具有丰富的种属多样性,揭示了深海微生物资源的丰富和潜力.ERICPCR和BOXPCR技术可用于对深海微生物群落组成和多样性的研究.

关 键 词:深海  淀粉酶  ERICPCR  BOX-PCR
文章编号:0438-0479(2005)Sup-0171-04
修稿时间:2004年12月21

The rep-PCR Fingerprints Analysis of Amylase-producing Bacteria Isolated from Deep-sea Sediments
DAI Shi-Kun,ZHENG Tian-ling,ZHENG Wei,WANG Xiao-Ying.The rep-PCR Fingerprints Analysis of Amylase-producing Bacteria Isolated from Deep-sea Sediments[J].Journal of Xiamen University(Natural Science),2005,44(Z1):171-174.
Authors:DAI Shi-Kun  ZHENG Tian-ling  ZHENG Wei  WANG Xiao-Ying
Institution:DAI Shi-Kun1,ZHENG Tian-Ling~1,2*,ZHENG Wei1,WANG Xiao-Ying1
Abstract:
Keywords:deep-sea  amylase  ERIC-PCR  BOX-PCR
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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