玉米CACTA型转座子携带宿主基因片段转移新功能的发现与特性分析 |
| |
引用本文: | 李青,李林,戴景瑞,李建生,严建兵.玉米CACTA型转座子携带宿主基因片段转移新功能的发现与特性分析[J].科学通报,2009,54(2):177-186. |
| |
作者姓名: | 李青 李林 戴景瑞 李建生 严建兵 |
| |
作者单位: | ① 中国农业大学国家玉米改良中心, 农业部作物基因组学与遗传改良重点实验室, 北京 100193;
② International Maize and Wheat Improvement Center (CIMMYT), ApartadoPostal 6-641, Mexico 06600, Mexico |
| |
基金项目: | 国家自然科学基金(批准号: 30500322)和国家高技术研究发展计划(批准号: 2006AA10Z183, 2006AA10A107)资助项目 |
| |
摘 要: | 携带宿主基因片段转座子的转座对基因组扩增、新基因产生具有重要作用. 本研究以参与玉米维生素E合成的基因HGGT为例, 采用生物信息学方法, 寻找携带宿主基因片段转座子, 并分析其特性. 通过BLAST搜索和基因注释, 发现了3个携带HGGT基因不同部位片段的ENSPM2_ZM转座子. 利用公共数据库, 在玉米自交系B73基因组中发现了另外66个能携带宿主基因片段的转座子. 这69个转座子分布在10条染色体上, 平均长度为3689 bp. 其中, 有9个转座子携带了2个来源的宿主基因片段. 通过比对玉米EST数据库, 发现至少13个转座子可以转录, 且2个携带不同来源宿主基因片段的转座子具有融合转录的特征.
|
关 键 词: | CACTA转座子 基因片段 基因组分布 嵌合转录本 玉米 |
收稿时间: | 2008-10-22 |
修稿时间: | 2008-12-14 |
本文献已被 CNKI 等数据库收录! |
| 点击此处可从《科学通报》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《科学通报》下载免费的PDF全文 |
|