| BoxCox变换对数量性状基因座位检测效率的影响 |
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| 引用本文： | 尹佟明. BoxCox变换对数量性状基因座位检测效率的影响[J]. 南京林业大学学报(自然科学版), 2010, 34(3): 35-38 |
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| 作者姓名： | 尹佟明 |
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| 作者单位： | 江苏省杨树种质创新与品种改良重点实验室,南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建重点实验室,江苏,南京,210037 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目，国家林业局林业公益性行业科研专项 |
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| 摘 要： | 数量基因位点(quantitative trait loci, QTL)分析是利用图位法克隆控制数量性状主效基因的前提和基础。采用BoxCox公式进行数据正态转换对提高QTL分析效率有显著作用。笔者以杨树为实例显示了BoxCox公式在数据正态转变中的应用及数量性状表型分布对QTL分析的影响。结果发现，数据是否符合正态分布对发现控制数量性状的基因位点有显著影响。如果不对性状的表型值进行分布检测并进行正态转变，可能无法发现某些有显著效应的遗传位点。通过比对转化前后QTL分析的LOD值变化曲线得知，曲线变化的趋势在转化前后是一致的，曲线上各个小峰的位置也是稳定的，但转化后LOD峰值显著提高。如第4染色体上，转化前后LOD值变化曲线上在40~60、80~100及130~150 cm区间均有3个独立峰值出现，数据转化后对应峰值升高，其中第1个峰的峰值约增加3倍，数据转化后该峰值LOD支持度达到了极显著水平，显示该位置存在一个控制该性状的较强的遗传位点。第8染色体上也出现相似的情况。
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| 关 键 词： | BoxCox变换 数量性状基因座位 图位克隆 |
Effect of BoxCox transformation on quantitative trait loci detection |
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| YIN Tong-ming. Effect of BoxCox transformation on quantitative trait loci detection[J]. Journal of Nanjing Forestry University(Natural Sciences ), 2010, 34(3): 35-38 |
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| Authors: | YIN Tong-ming |
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| Affiliation: | Jiangsu Key Laboratory for Poplar Germplasm Enhancement and Variety Improvement, Key Laboratory of Forest Geneticsand Biotechnology Ministry of Education, Nanjing Forestry University, Nanjing 210037, China |
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| Keywords: | |
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