| 梅花鹿抗病毒蛋白的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 边帅. 梅花鹿抗病毒蛋白的生物信息学分析[J]. 科学技术与工程, 2018, 18(29) |
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| 作者姓名： | 边帅 |
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| 作者单位： | 长春中医药大学吉林省人参科学研究院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（No.81503324） |
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| 摘 要： | 通过在线生物软件分析梅花鹿四种抗病毒蛋白A3Z2、BST-2A、BST-2B和SAMHD1蛋白的生物信息学特性。从转录组中获得四种蛋白的基因序列,应用Prot Param、Protscale、SOPMA、TMHMM、Target P、Signal P、Motif Scan、Interproscan以及BLAST等在线软件分析蛋白的理化性质、二级结构、穿膜域、结构域等等。首次获得了四种抗病毒因子的基因和蛋白序列,梅花鹿A3Z2基因编码393个氨基酸,相对分子质量为47.59 k Da,碱性,不稳定性亲水蛋白,无信号肽和跨膜结构域,胞内定位,具有糖基化和磷酸化位点,两个胞嘧啶脱氨酶结构域。梅花鹿BST-2A和2B基因编码159个氨基酸,相对分子质量为17.69 k Da和18.12 k Da,酸性,不稳定性亲水蛋白,无信号肽,BST-2A有两个跨膜结构域,BST-2B有一个跨膜结构域,膜定位,具有糖基化和磷酸化位点。梅花鹿SAMHD1基因编码613个氨基酸,相对分子质量为70.51 k Da,碱性,不稳定性亲水蛋白,无信号肽和跨膜结构域,胞内定位,具有磷酸化位点,d NTP磷酸水解酶活性结构域。梅花鹿A3Z2、BST-2A、BST-2B和SAMHD1蛋白具有潜在的抗病毒能力。
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| 关 键 词： | 梅花鹿 抗病毒蛋白 生物信息学 |
| 收稿时间： | 2018-05-09 |
| 修稿时间： | 2018-06-26 |
Bioinformatic analysis of sika deer antiviral proteins |
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| bianshuai. Bioinformatic analysis of sika deer antiviral proteins[J]. Science Technology and Engineering, 2018, 18(29) |
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| Authors: | bianshuai |
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| Affiliation: | Jilin?Ginseng?Academy, Changchun University of Chinese Medicine |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | sika deer antiviral protein bioinformatic |
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