| 基于高通量分子对接技术筛选干预COVID-19的潜在活性分子及中药 |
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| 引用本文： | 祁建宏,董芳旭,王轲,刘子铭,朱锦璐.基于高通量分子对接技术筛选干预COVID-19的潜在活性分子及中药[J].北京联合大学学报(自然科学版),2022,36(1):44-53,71. |
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| 作者姓名： | 祁建宏 董芳旭 王轲 刘子铭 朱锦璐 |
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| 作者单位： | 山东中医药大学 药学院,济南 250355;山东中医药大学 外国语学院,济南 250355;山东中医药大学 中医药创新研究院,济南 250355 |
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| 摘 要： | 2019年12月以来,由严重急性呼吸综合征冠状病毒2型(severe acute respiratory syndrome coronavirus-2,SARS-CoV-2)感染引起的新型冠状病毒肺炎(novel coronavirus disease 2019,COVID-19)在全球范围内流行和传播,具有较高的传染性、发病率和死亡率.目前,国内外仍缺乏特效且无明显副作用的治疗药物.基于COVID-19的特异性靶点(AXL、3CL pro、ACE2),利用高通量分子对接技术在TCMSP数据库中虚拟筛选潜在活性小分子,并从TCMSP、TCMIP和TCMID数据库中预测相应的潜在中药.结果显示,作用于AXL、3CL pro和ACE2的共靶点小分子有47个,包括萜类、生物碱类、黄酮类、醌类和苷类等,其中萜类所占比例最高.其中Chelidimerine与AXL和3CL pro的结合能力最强,可能是一种治疗COVID-19的潜在化合物.基于ADME和Lipinski规则,得到10个具有良好药代动力学特征的化合物.此外,预测获得了13味治疗COVID-19的高频中药.本实验获得的针对COVID-19的潜在活性分子(PAM)和潜在中药,可为后续的抗病毒活性研究、新药开发和临床应用提供有意义的参考.
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| 关 键 词： | 受体酪氨酸激酶(AXL) 血管紧张素转换酶2(ACE2) 3C样蛋白酶(3CL pro) COVID-19 潜在活性分子 中药 |
Screening Potential Active Molecules and Chinese Herbs in Intervention of COVID-19 Based on High-throughput Molecular Docking Technology |
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| QI Jianhong,DONG Fangxu,WANG Ke,LIU Ziming,ZHU Jinlu.Screening Potential Active Molecules and Chinese Herbs in Intervention of COVID-19 Based on High-throughput Molecular Docking Technology[J].Journal of Beijing Union University,2022,36(1):44-53,71. |
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| Authors: | QI Jianhong DONG Fangxu WANG Ke LIU Ziming ZHU Jinlu |
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