国产大蒜凝集素基因的克隆与生物信息学分析

为了获得国产大蒜新的凝集素家族基因，根据NCBI数据库中已公布的大蒜凝集素基因序列设计引物，从国产大蒜的鳞茎中提取总RNA，采用RT-PCR技术分离克隆出一个大蒜凝集素基因，命名为ASA-C。ASA-C全长546 bp，包含1个471 bp的ORF，编码156个氨基酸的多肽。利用网站和分析软件对其进行生物信息学分析。结果 表明：ASA-C与已公布的同源二聚体大蒜凝集素ASAⅡ基因具有较高同源性；推测该基因编码多肽的N端有一典型跨膜结构域的信号肽，多肽序列上有3个甘露糖特异性结合凝集素共有基序（Q-D-N-V-Y）。多重序列比对以及系统进化树的结果 表明大蒜凝集素的保守性很强，这为进一步开发利用大蒜凝集素蛋白的功能奠定了基础。