| 基于氨基酸组分和支持向量机的动物毒素的预测 |
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| 引用本文： | 杨磊,李前忠,左永春,李涛.基于氨基酸组分和支持向量机的动物毒素的预测[J].内蒙古大学学报(自然科学版),2009,40(4). |
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| 作者姓名： | 杨磊 李前忠 左永春 李涛 |
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| 作者单位： | 内蒙古大学物理科学与技术学院理论生物物理研究室,呼和浩特,010021 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目，内蒙古自然科学基金资助项目，内蒙古自治区优秀学科带头人资助项目 |
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| 摘 要： | 动物毒素是一种具有非常广泛用途的生物毒素,有必要提出一种能够快速、准确预测动物毒素的理论算法.基于动物毒素蛋白质序列的二肽组分信息,提出了一种离散增量结合支持向量机的ID-SVM的算法,并使用此算法对不同序列相似性的动物毒素进行了预测,取得了较好的结果.为了说明ID-SVM算法在预测生物毒素方面的优越性,在这里将ID-SVM算法应用到Saha和Raghava构建的细菌毒素和非毒素的数据库上,预测结果显示ID-SVM算法的预测结果高于Saha和Raghava所用算法的结果.
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| 关 键 词： | 动物毒素 离散增量 支持向量机 序列相似性 |
Prediction of Animal Toxins Using Amino Acid Composition and Support Vector Machine |
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| YANG Lei,LI Qian-zhong,ZUO Yong-chun,LI Tao.Prediction of Animal Toxins Using Amino Acid Composition and Support Vector Machine[J].Acta Scientiarum Naturalium Universitatis Neimongol,2009,40(4). |
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| Authors: | YANG Lei LI Qian-zhong ZUO Yong-chun LI Tao |
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