使用遗传算法优化登革热病毒信封蛋白的肽抑制剂 |
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作者姓名: | 贺子豪 赵俊强 杨敏 张松杰 徐永涛 |
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作者单位: | 新乡医学院生物医学工程学院,河南新乡453000;新乡市生物医学信息研究重点实验室,河南新乡453000;临床与生物医学大数据融合技术河南省工程实验室,河南新乡453000;新乡医学院三全学院,河南新乡453000;新乡市智能医学虚拟重点实验室,河南新乡453000 |
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基金项目: | 国家自然科学基金;教育部国家留学基金;新乡医学院科研启动经费;新乡医学院科研启动经费;新乡医学院生物医学工程学院开放课题;新乡医学院生物医学工程学院开放课题;新乡医学院生物医学工程学院开放课题;河南省高等学校青年骨干教师培养计划 |
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摘 要: | 登革热病毒严重威胁了人类的健康.目前仍无有效的治疗措施.膜融合是登革热病毒入侵细胞的第一步.信封蛋白的构象变化在膜融合过程中起到关键作用.研发针对信封蛋白的肽抑制剂为治疗登革热提供了潜在的重要靶点.设计了优化针对信封蛋白的肽抑制剂的遗传算法,分别使用3种不同的选择算子(轮盘法、锦标赛法和并行法),对初始父代进行300代的优化.通过比较发现并行法的结果较好,命名最优的结果为DN58ga.与此同时还获得了一些多肽衍生物.通过计算验证,这些多肽比父代表现出与登革热病毒信封蛋白更好的结合能力.这些新的肽抑制剂有可能打断融合过程中的蛋白-蛋白相互作用,并有望作为开发登革热病毒信封蛋白新型抑制剂的起点.
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关 键 词: | 登革热病毒 膜融合 信封蛋白 肽抑制剂 遗传算法 |
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