| 乌鳢β-肌动蛋白cDNA克隆与表达分析 |
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| 引用本文： | 李锐,文正勇,覃川杰,邹远超,王均,贺扬,袁登越.乌鳢β-肌动蛋白cDNA克隆与表达分析[J].四川师范大学学报(自然科学版),2018(5). |
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| 作者姓名： | 李锐 文正勇 覃川杰 邹远超 王均 贺扬 袁登越 |
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| 作者单位： | 内江师范学院生命科学学院;内江师范学院长江上游鱼类资源保护与利用四川省重点实验室 |
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| 摘 要： | 利用RT-PCR技术首次克隆获得了乌鳢(Channa argus)的β-肌动蛋白基因cDNA序列.结果显示,乌鳢β-肌动蛋白的cDNA序列全长1 813bp,包含一个1 125bp的开放阅读框(ORF),共编码375个氨基酸.蛋白序列分析显示,乌鳢β-肌动蛋白的相对分子质量为41.731kDa,等电点PI为5.16,由20种氨基酸组成(甘氨酸数目占比最高为7.73%,色氨酸数目占比最低为1.07%),含有3个actin信号位点.蛋白同源性分析显示,乌鳢β-肌动蛋白与大西洋鲑、虹鳟、莫桑比克罗非鱼的同源性达99%以上,与非洲爪蟾、鸡和人等脊椎动物的同源性达98%以上,表明β-肌动蛋白基因在不同物种之间具有很高的保守性.基于NJ法的β-actin基因系统发育分析显示,乌鳢处于鲈形目和鲑形目鱼类的基部,并没有与鲈形目鱼类聚类为一支,表明乌鳢β-actin基因的进化速率较其他鲈形目鱼类更慢.组织表达分析显示,乌鳢β-actin在检测的11个组织中均有表达,且表达量比较稳定,表明该基因可作为内参选择时的候选基因,可为乌鳢功能基因研究时的内参选择提供参考.
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