杨树人工林土壤细菌DNA的提取与扩增 |
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引用本文: | 倪桂萍,王延平,王华田,韩亚飞,桑亚林.杨树人工林土壤细菌DNA的提取与扩增[J].山东大学学报(理学版),2013,48(5). |
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作者姓名: | 倪桂萍 王延平 王华田 韩亚飞 桑亚林 |
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作者单位: | 山东农业大学林学院,山东省森林培育重点实验室,山东农业大学农业环境与生态重点实验室,山东泰安271018 |
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基金项目: | 国家自然科学基金资助项目,山东省优秀中青年科学家奖励基金资助项目 |
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摘 要: | 土壤微生物多样性反映土壤生态系统健康程度,对土壤养分循环发挥决定作用,并在很大程度上影响林地生产力.为研究人工林长期经营对土壤微生物多样性的影响,本研究以杨树人工林为研究对象,取连作林地根际和非根际土壤,采用MOBIO PowerSoil DNA Isolation kit试剂盒提取土壤中微生物基因组DNA,并进行16S rDNA V3区扩增.结果表明:6种杨树人工林土壤中均能提取出微生物基因组DNA,基因组DNA片段大于2 000 bp,且DNA带型清晰完整,无明显降解,为后续土壤细菌的PCR扩增提供了良好模板;6种土壤基因组DNA在电泳图中的亮度不一,其中Ⅰ代林根际土壤(B3)微生物DNA条带最亮,Ⅲ代林非根际土壤(FB18)微生物DNA条带亮度最弱,经检测,B3样品DNA含量约为6.9 ng·cm-3,而FB18仅有2.0 ng·cm-3左右;选用27F/1492R和F338-GC/R518两对引物,采用巢式PCR策略,成功扩增出杨树人工林土壤细菌16S rDNA V3区DNA,片段大小为220 bp左右.
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关 键 词: | 杨树人工林 土壤细菌DNA 巢式PCR |
Extraction and amplification of bacterial DNA from soils of poplar plantation |
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Abstract: | |
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