| W301水分子在HIV-1蛋白酶和配体ABT-538结合中作用的QM/MM研究 |
| |
| 引用本文： | 刘宝山,张少龙,张庆刚. W301水分子在HIV-1蛋白酶和配体ABT-538结合中作用的QM/MM研究[J]. 山东师范大学学报(自然科学版), 2008, 23(4) |
| |
| 作者姓名： | 刘宝山 张少龙 张庆刚 |
| |
| 作者单位： | 山东师范大学物理与电子科学学院,250014,济南;山东师范大学物理与电子科学学院,250014,济南;山东师范大学物理与电子科学学院,250014,济南 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目(10474060,10504017); 山东省自然科学基金资助项目(Q2006A06) |
| |
| 摘 要： | 结晶水分子W301在几乎所有的HIV-1蛋白酶（HIV-1PR）和配体的晶体结构中出现．在HIV-1PR中A链天门冬氨酸残基Asp25质子化状态或B链Asp25质子化状态下，QyaraM模拟后MM—GBSA方法计算得到W301水分子在HIV-1PR／ABT-538结合中的自由能贡献分别为-1．6．88kJ／mol、-17．63kJ／mol，W301水分子在HIV-1PR／ABT-538的结合中起到了关键的作用．进一步分析发现W301水分子与HIV-1PR和ABT-538分别形成了两个、四个氢键．
|
| 关 键 词： | QM/MM方法 HIV-1蛋白酶 结合自由能 MM-GBSA |
QM/MM RESEARCH OF THE W301 IN HIV- 1 PROTEASE/ABT- 538 COMPLEX |
| |
| Liu Baoshan,Zhang Shaolong,Zhang Qinggang. QM/MM RESEARCH OF THE W301 IN HIV- 1 PROTEASE/ABT- 538 COMPLEX[J]. Journal of Shandong Normal University(Natural Science), 2008, 23(4) |
| |
| Authors: | Liu Baoshan Zhang Shaolong Zhang Qinggang |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | hybrid QM/MM HIV-1 Protease binding free energy MM-GBSA |
| 本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录！ |
