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应用改进的共鸣识别模型预测蛋白质相互作用
引用本文:刘翔,王翼飞.应用改进的共鸣识别模型预测蛋白质相互作用[J].上海大学学报(自然科学版),2006,12(1):69-73.
作者姓名:刘翔  王翼飞
作者单位:上海大学,理学院,上海,200444
摘    要:蛋白质是所有生命活动的载体,它们之间的相互作用在生命活动中起着至关重要的作用.该文介绍了原有的用于预测蛋白质相互作用的共鸣识别模型,并对该模型运用小波变换进行改进,提出了改进后的共鸣识别模型.该模型的最大特点在于直接通过蛋白质的一级结构预测蛋白质之间的相互作用,改进后的模型较原模型更加适合于蛋白质相互作用的预测.运用改进的共鸣识别模型进行了数值试验,取得了较好的预测效果.

关 键 词:蛋白质相互作用  共鸣识别模型  离散小波变换  特征频率
文章编号:1007-2861(2006)01-0069-05
收稿时间:2005-03-14
修稿时间:2005年3月14日

Prediction of Protein-Protein Interaction Using Modified Resonant Recognition Model
LIU Xiang,WANG Yi-fei.Prediction of Protein-Protein Interaction Using Modified Resonant Recognition Model[J].Journal of Shanghai University(Natural Science),2006,12(1):69-73.
Authors:LIU Xiang  WANG Yi-fei
Institution:School of Sciences,Shanghai University, Shanghai 200444, China
Abstract:The protein-protein interaction is crucial in biological processes as any biological process in living organism is based on proteins.This paper discusses the original resonant recognition model,and introduces a modified resonant recognition model using wavelet transform.The new model is more suitable for the prediction of the protein-protein interaction.Numerical experiments show a good result in protein-protein interaction prediction.
Keywords:protein-protein interaction  resonant recognition model  discrete wavelet transform  characteristics frequency
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