基于转录因子信号识别基因的表达水平 |
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作者姓名: | 杨彦超 柴露 刘俊杰 张利绒 |
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作者单位: | 内蒙古大学物理科学与技术学院,呼和浩特010021 |
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基金项目: | 国家自然科学基金;国家自然科学基金 |
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摘 要: | 真核生物的基因表达调控过程十分复杂,各种转录因子通过与基因上游特异性序列结合协同地对靶基因的表达水平进行调控.以人类GM12878细胞系为研究对象,基于表达谱RNA-seq数据构建了高低表达基因集合,利用74种转录因子(TF)的ChIP-seq峰值数据计算了转录因子和靶基因的关联分数(TFAS),进而根据转录因子间的相...
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关 键 词: | 转录因子 基因表达水平 卷积神经网络 预测 |
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