基于高通量培养分析稻虾共作模式土壤的细菌群落 |
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作者姓名: | 宋蕾蕾 孙文晓 焦可欣 陈钰璐 邹淑琪 张淅月 徐晨伟 张杨 戴传超 |
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作者单位: | 1. 南京师范大学生命科学学院,江苏省微生物资源产业化工程技术研究中心,江苏省微生物与功能基因组学重点实验室;2. 江苏省农业农村污染防治技术与装备工程研究中心;3. 南通科技职业学院 |
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基金项目: | 国家自然科学基金青年项目(32001210);;江苏省高校自然科学基金面上项目(22KJB180003);;江苏省级大学生创新创业训练项目(202210319101Y); |
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摘 要: | 高通量测序技术的发展发现并鉴定了土壤微生物的未培养物种,然而,仅依赖非培养的高通量测序无法获得发挥关键功能的微生物培养物,限制了对其功能的验证及其应用,这对关键功能微生物的机理性研究和应用具有一定的局限性.本研究以稻虾共作和水稻单作两种稻作模式的土壤样品为研究对象,分别对比了传统平板涂布、96孔培养板划线分离以及将非培养和培养法相结合的——“96孔高通量培养法”3种方法的土壤细菌分类差异、菌群多样性、组成特异性以及细菌功能特征.结果表明,相对于传统涂布培养法,96孔高通量培养法所获取的细菌数量高约5倍,能鉴定到属的培养物高约4倍,预测功能鉴定提高约2倍.由此可见,“96孔高通量培养法”大大提高了对土壤细菌培养物的获取和鉴定率.本研究弥补了传统培养法的获得率低的不足,拓宽了高通量培养技术的应用领域,同时,也为进一步揭示稻虾共作模式参与土壤生态变化过程的微生物机制提供研究基础.
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关 键 词: | 高通量测序 稻虾共作模式 涂布培养法 土壤微生物群落 |
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