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Perl语言统计核酸GC含量程序开发
摘 要:
生命科学领域中无论是PCR还是测序,都需要了解目的核酸的GC含量。由于目前缺乏独立统计核酸GC含量的程序。该文采用Perl语言编程,设计处理了核酸序列统计GC含量的程序。程序采用了BioPerl环境,利用字符串拆分、遍历算法和正则表达式对核酸序列进行GC碱基的挖掘。最后该脚本可以应用于Windows和Linux系统。适合用于多环境。
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