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甘蓝型油菜过氧化物酶的生物信息学分析
作者姓名:林睿  叶思萍  李雨澎  杨文闯  郭笑
作者单位:1. 北华大学药学院;2. 北华大学基础医学院
基金项目:国家自然科学基金青年基金项目(3900918);;北华大学研究生创新项目(2021022);
摘    要:目的 分析甘蓝型油菜的过氧化物酶(Peroxiredoxin, PRDX)家族成员的生物学信息,以期为油菜及相近植物中PRDX的酶学特征及植物抗氧化的分子机制研究提供依据.方法 利用生物信息学方法,分析NCBI(National Center for biotechnology information)数据库中注册的7种油菜PRDX蛋白质的理化性质、信号肽、磷酸化位点、糖基化位点、蛋白质二级结构、三级结构及系统进化特点.结果 甘蓝型油菜PRDX蛋白质比较稳定;氨基酸序列中无信号肽,且不是分泌蛋白;该家族蛋白质中存在较多潜在糖基化位点和磷酸化位点;蛋白质二级结构、三级结构预测结果显示其结构具有极大相似性,且主要以α-螺旋和无规则卷曲为主;系统进化树将该家族成员分为了两个亚家族.结论 本研究为进一步探索植物PRDX家族的生物学功能提供了参考依据.

关 键 词:生物信息学  甘蓝型油菜  过氧化物酶
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