| 菠菜转录因子MYB基因家族的鉴定及表达分析 |
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| 引用本文： | 王晓珊,葛晨辉,康亚妮,王全华,徐晨曦. 菠菜转录因子MYB基因家族的鉴定及表达分析[J]. 上海师范大学学报(自然科学版), 2020, 49(6): 677-691 |
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| 作者姓名： | 王晓珊 葛晨辉 康亚妮 王全华 徐晨曦 |
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| 作者单位： | 上海师范大学生命科学学院,上海200234;上海师范大学植物种质资源开发协同创新中心,上海200234;上海师范大学生命科学学院,上海200234;上海师范大学植物种质资源开发协同创新中心,上海200234;上海师范大学生命科学学院,上海200234;上海师范大学植物种质资源开发协同创新中心,上海200234;上海师范大学生命科学学院,上海200234;上海师范大学植物种质资源开发协同创新中心,上海200234;上海师范大学生命科学学院,上海200234;上海师范大学植物种质资源开发协同创新中心,上海200234 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金青年基金（31601769）；上海市科研创新行动计划（16391901000）；上海植物种质资源工程技术研究中心项目（17DZ2252700） |
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| 摘 要： | 利用生物信息学手段鉴定了76个具有典型R结构的菠菜转录因子(Spinacia oleracea)MYB,其中包括72条R2R3-MYB基因(2R-MYB)和4条R1R2R3-MYB基因(3R-MYB)。通过生物信息学对菠菜MYB转录因子家族成员的理化性质、染色体定位、结构域序列保守性和系统进化关系进行了分析,结果表明:菠菜MYB家族有32个基因位于染色体正链,另外44个基因位于染色体反链;MYB的DNA结合域中的保守域主要位于两个R重复序列的第二和第三螺旋之间,结合域中每个R重复的第一和第二色氨酸之间的氨基酸序列相对不保守;根据菠菜、拟南芥及甜菜的MYB家族系统进化关系可以推测,菠菜MYB家族中56个成员可以按功能划分为4类,在菠菜的生长发育过程中可能起着重要的调节作用,其余成员中有7个MYB基因可能参与菠菜响应氮素浓度的氮素利用及生长发育进程。
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| 关 键 词： | 菠菜(Spinacia oleracea) 转录因子MYB 氮素处理 基因表达 |
| 收稿时间： | 2020-09-01 |
Identification and expression analysis of MYB transcription factor family in spinach |
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| WANG Xiaoshan,GE Chenhui,KANG Yani,WANG Quanhua and XU Chenxi. Identification and expression analysis of MYB transcription factor family in spinach[J]. Journal of Shanghai Normal University(Natural Sciences), 2020, 49(6): 677-691 |
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| Authors: | WANG Xiaoshan GE Chenhui KANG Yani WANG Quanhua XU Chenxi |
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| Affiliation: | College of Life Sciences, Shanghai Normal University, Shanghai 200234, China;Development Center of Plant Germplasm Resources, Shanghai Normal University, Shanghai 200234, China,College of Life Sciences, Shanghai Normal University, Shanghai 200234, China;Development Center of Plant Germplasm Resources, Shanghai Normal University, Shanghai 200234, China,College of Life Sciences, Shanghai Normal University, Shanghai 200234, China;Development Center of Plant Germplasm Resources, Shanghai Normal University, Shanghai 200234, China,College of Life Sciences, Shanghai Normal University, Shanghai 200234, China;Development Center of Plant Germplasm Resources, Shanghai Normal University, Shanghai 200234, China and College of Life Sciences, Shanghai Normal University, Shanghai 200234, China;Development Center of Plant Germplasm Resources, Shanghai Normal University, Shanghai 200234, China |
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