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基于线粒体DNA控制区的新疆北鲵种群遗传多样性分析
引用本文:袁亮,李伟业,叶小芳,王秀玲.基于线粒体DNA控制区的新疆北鲵种群遗传多样性分析[J].厦门大学学报(自然科学版),2015(2):194-198.
作者姓名:袁亮  李伟业  叶小芳  王秀玲
作者单位:新疆师范大学生命科学学院新疆特殊环境物种多样性应用与调控重点实验室;广东省昆虫研究所
基金项目:新疆维吾尔自治区国际科技合作基金(20126009);新疆维吾尔自治区自然科学基金(2011211B17)
摘    要:以线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)控制区为分子标记,对分布于新疆温泉县6处自然栖息地的新疆北鲵(Ranodon sibiricus)遗传多样性进行研究.共采集新疆北鲵尾端肌肉组织样本60份,通过PCR扩增获得853bp的mtDNA序列,含D-loop序列747bp、tRNA-Pro序列72bp及部分tRNA-Thr和tRNA-Pro之间基因间隔区(ISR)序列34bp,其中D-loop序列中A、T、G和C 4种核苷酸所占百分比分别为31.92%,35.04%,15.02%和18.02%,A+T所占百分比为66.96%.经MEGA软件比对发现,所得60个样品的扩增序列(853bp)完全一致,共享一个单倍型,所有扩增序列仅在控制区的第449位碱基(均为A)与GenBank(AJ419960)中新疆北鲵线粒体该位点碱基(为G)不一致.结果表明,国内现存6处自然栖息地内的新疆北鲵遗传多样性极低,在近缘同属种及脊椎动物中都极为罕见,显示该种近期经历过严重的瓶颈效应,可能由一个单倍型扩散至目前的分布格局.研究结果可为该物种保护提供分子遗传学依据.

关 键 词:新疆北鲵  线粒体DNA  D-loop  遗传多样性
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