| 基于启发式方法和支持向量机定量研究药物的血脑屏障通透性 |
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| 引用本文： | 阮晓芳,张瑞生,胡荣静,袁永娜,刘满仓,范波涛.基于启发式方法和支持向量机定量研究药物的血脑屏障通透性[J].兰州大学学报(自然科学版),2007,43(5):78-83. |
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| 作者姓名： | 阮晓芳 张瑞生 胡荣静 袁永娜 刘满仓 范波涛 |
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| 作者单位： | 兰州大学,化学化工学院,甘肃,兰州,730000;兰州大学,化学化工学院,甘肃,兰州,730000;兰州大学,信息科学与工程学院,甘肃,兰州,730000;巴黎第七大学,ITODYS研究所,法国,巴黎,75005 |
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| 摘 要： | 构建55个药物分子与其血脑屏障通透性(logB)之间的定量结构-性质关系模型,探讨影响药物血脑屏障通透性的结构因素.应用CODESSA软件计算55个化合物的组成、拓扑、几何、静电和量子化学等结构参数,通过启发式方法筛选得到最佳的结构参数,并建立线性回归模型;用所选的4个结构参数作为支持向量机的输入,建立非线性的支持向量机回归模型.预测结果表明:支持向量机回归模型性能(R2=0.89,MSE=0.06)要优于启发式回归模型的性能(R2=0.82,MSE=0.11).描述符HASA2,NO,FPSA3和E(CH)都是影响logB的主要结构因素.支持向量机模型简单快速,在药物设计中可以用来预测候选药物的logB值.
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| 关 键 词： | 血脑屏障 启发式方法 支持向量机 定量结构-性质关系 |
| 文章编号： | 0455-2059（2007）05-0078-06 |
| 修稿时间： | 2006-11-21 |
QSAR study of blood-brain barrier permeation using the heuristic method and support vector machine |
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| RUAN Xiao-fang,ZHANG Rui-sheng,HU Rong-jing,YUAN Yong-na,LIU Man-cang,FAN Bo-tao.QSAR study of blood-brain barrier permeation using the heuristic method and support vector machine[J].Journal of Lanzhou University(Natural Science),2007,43(5):78-83. |
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| Authors: | RUAN Xiao-fang ZHANG Rui-sheng HU Rong-jing YUAN Yong-na LIU Man-cang FAN Bo-tao |
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| Institution: | 1. College of Chemistry and Chemical Engineering, Lanzhou University, Lanzhou 730000, China; 2. School of Information Science and Engineering, Lanzhou University, Lanzhou 730000, China; 3. Université Paris 7-Denis Diderot, ITODYS 1, Rue Guy de la Brosse, 75005 Paris, France |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | brain-blood barrier heuristic method support vector machine quantitative structure-activity relationship |
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