甜菜夜蛾核多角体病毒基因组13.7~21.6 m.u.区域的分析 |
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作者姓名: | 杨凯 代小江 彭亚玲 VLAK Just 庞义 |
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作者单位: | 1. 中山大学生物防治国家重点实验室,广东,广州,510275 2. 荷兰Wageningen大学病毒学实验室,Wageningen,Binnenhaven 11,6709 PD |
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基金项目: | 国家重点基础研究发展规划(973)资助项目(G2000016209),国家高技术研究发展计划(863)资助项目(2001AA214031-2),杜邦公司支持的欧共体"援助教育"项目资助 |
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摘 要: | 甜菜夜蛾核多角体病毒(Spodoptera exigua multicapsid nucleopolyhedrovirus,SeMNPV)基因组13.7~21.6m.u.区域是SeMNPV的重组热点区。以SeMNPV美国分离株SeUS1为模板,长片段PCR对SeUS1的13.7~21.6m.u.区域扩增,得到11.3kb,2.0kb和0.7kb3个片段。对照已发表的SeMNPV基因组序列,11.3kb片段是具完整SeMNPV序列基因型的产物,2.0kb和0.7kb片段表明SeUS1中还存在两种缺失突变株。对2.0kb和0.7kb片段的序列分析揭示了这两株突变株在缺失部位的DNA一级结构。对三株重组SeMNPV病毒(SeXDl、SeXD2和SeXD3)的分析发现,它们和野生型病毒SeUS1中的一个基因型一样,均缺失了SeMNPV nt 18513~29105之间长10593bp的片段,暗示SeUS1中一株自发形成的缺失突变体在离体细胞中具有复制优势。将该片段基因排列与其它10种基因组序列已测定的杆状病毒比较,发现两个在GroupⅡ NPVs中保守的基因簇。最大简约性法对部分基因的系统发育分析表明,缺失片段中某些基因可能存在于杆状病毒分化之前的病毒基因组中。
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关 键 词: | 甜菜夜蛾核多角体病毒 缺失突变株 基因排列 系统发育分析 |
文章编号: | 0529-6579(2003)05-0054-05 |
修稿时间: | 2002-11-07 |
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