| 新型冠状病毒主蛋白酶天然产物抑制剂的筛选 |
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| 引用本文： | 师云凡,鞠壮,丁显平. 新型冠状病毒主蛋白酶天然产物抑制剂的筛选[J]. 四川大学学报(自然科学版), 2023, 60(4): 046001 |
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| 作者姓名： | 师云凡 鞠壮 丁显平 |
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| 作者单位： | 四川大学生命科学学院; 特色生物资源研究与利用川渝共建重点实验室,四川大学生命科学学院; 特色生物资源研究与利用川渝共建重点实验室,四川大学生命科学学院; 特色生物资源研究与利用川渝共建重点实验室 |
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| 基金项目： | 四川省科技厅项目（2020JDS0039） |
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| 摘 要： | 为寻找新型冠状病毒主蛋白酶天然产物抑制剂，本文以SARS-CoV-2主蛋白酶为研究对象，通过计算机辅助药物筛选方法初步筛选出16个潜在抑制剂并进行体外酶活测试.其中，野黄岑素对SARS-CoV-2主蛋白酶的IC50为（10.79 ± 2.116 ） μmol/L，没食子儿茶素没食子酸酯抑制SARS-CoV-2主蛋白酶的IC50为（2.104 ± 0.346） μmol/L.最后，将两种天然产物与主蛋白酶进行分子动力学模拟发现没食子儿茶素没食子酸酯和野黄岑素与新型冠状病毒主蛋白酶结合时的复合物RMSD都在0.22 ?附近，说明两个天然产物与新型冠状病毒主蛋白酶结合较为稳定，可以作为新型冠状病毒主蛋白酶的抑制剂或先导化合物.
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| 关 键 词： | 新型冠状病毒主蛋白酶； 基于结构的虚拟筛选； 没食子儿茶素没食子酸酯； 野黄岺素； 分子动力学模拟 |
| 收稿时间： | 2022-11-29 |
| 修稿时间： | 2023-03-02 |
Screening of natural product inhibitors targeting SARS-CoV-2 main protease |
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| SHI Yun-Fan,JU Zhuang and DING Xian-Ping. Screening of natural product inhibitors targeting SARS-CoV-2 main protease[J]. Journal of Sichuan University (Natural Science Edition), 2023, 60(4): 046001 |
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| Authors: | SHI Yun-Fan JU Zhuang DING Xian-Ping |
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| Affiliation: | College of Life Sciences, Sichuan University; Joint Key Lab of Sichuan&Chongqing, Bioresource Res & Utilizat,College of Life Sciences, Sichuan University; Joint Key Lab of Sichuan&Chongqing, Bioresource Res & Utilizat,College of Life Sciences, Sichuan University; Joint Key Lab of Sichuan&Chongqing, Bioresource Res & Utilizat |
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