DNA序列碱基组合的频率矩阵及其应用 |
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作者姓名: | 李玉双 刘倩 张昱 |
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作者单位: | 燕山大学理学院;石家庄邮电职业技术学院计算机系 |
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基金项目: | 国家自然科学基金资助项目(11201409) |
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摘 要: | 基于碱基组合在DNA序列中出现的频率,构造11个物种的β-globin基因第一个外显子的编码序列的频率矩阵.借助矩阵2-范数对11个物种进行相似性比较,并结合柱状图对物种之间的相似性进行分析.研究结果表明:所构造的DNA序列频率矩阵不仅能够反映出DNA序列中碱基及碱基组合的含量分布,而且能够显示出序列碱基突变的情况.
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关 键 词: | DNA 碱基组合 频率矩阵 相似性 编码序列 |
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