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DNA序列碱基组合的频率矩阵及其应用
作者姓名:李玉双  刘倩  张昱
作者单位:燕山大学理学院;石家庄邮电职业技术学院计算机系
基金项目:国家自然科学基金资助项目(11201409)
摘    要:基于碱基组合在DNA序列中出现的频率,构造11个物种的β-globin基因第一个外显子的编码序列的频率矩阵.借助矩阵2-范数对11个物种进行相似性比较,并结合柱状图对物种之间的相似性进行分析.研究结果表明:所构造的DNA序列频率矩阵不仅能够反映出DNA序列中碱基及碱基组合的含量分布,而且能够显示出序列碱基突变的情况.

关 键 词:DNA  碱基组合  频率矩阵  相似性  编码序列
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