| 核酸序列非均匀指数(HI)的约化 |
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| 引用本文： | 晋宏营,李宏.核酸序列非均匀指数(HI)的约化[J].内蒙古大学学报(自然科学版),2002,33(3):283-287. |
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| 作者姓名： | 晋宏营 李宏 |
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| 作者单位： | 内蒙古大学理工学院物理系,内蒙古,呼和浩特,010021 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金 ( 1 0 1 4 72 0 4 )，内蒙自然科学基金资助项目 |
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| 摘 要： | 考虑到在计算 H I值时 ,任何一种碱基在序列中出现的理论频数都应该大于 5 ,故而对原 H I公式进行了约化处理 ,并将约化后的 H I值与原 H I值作了对比 ,发现不同的约化方式所得到的 H I值在描述序列不均匀性时的效果是不同的 ,用编码区所偏好的约化语言进行约化后所得到的 H I值在应用于高 GC含量、中 GC含量以及总共的外显子和内含子的识别时 ,其效果要优于原 H I值
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| 关 键 词： | 识别 外显子 内含子 约化语言 非均匀指数 |
| 文章编号： | 1000-1638(2002)03-0283-05 |
| 修稿时间： | 2001年12月19 |
Reduction of Heterogeneity index (HI) of Nucleic Acid Sequences |
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| JIN Hong ying,LI Hong.Reduction of Heterogeneity index (HI) of Nucleic Acid Sequences[J].Acta Scientiarum Naturalium Universitatis Neimongol,2002,33(3):283-287. |
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| Authors: | JIN Hong ying LI Hong |
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| Abstract: | Because the expected number of every kind of base in sequences ought to be more than 5 when the HI is applied to describe the heterogeneity of sequences, the original HI is reduced. After comparing the reduced HI with the original HI, some conclusions are drawn. The effects of the reduced HI using different reduced languages are different in indicating the heterogeneity of sequences.The reduced HI using reduced language that is preferred by coding region is more effective than the original HI when they are applied to identify not only high G C content or medium G C content but also total exons and introns. |
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| Keywords: | recognition exon intron reduced language heterogeneity index |
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