| 基于时序互信息构建基因调控网络 |
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| 引用本文： | 缑葵香,宫秀军,汤莉.基于时序互信息构建基因调控网络[J].天津大学学报(自然科学与工程技术版),2010(7). |
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| 作者姓名： | 缑葵香 宫秀军 汤莉 |
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| 作者单位： | 缑葵香,GOU Kui-xiang(天津大学理学院,天津,300072;天津大学计算机科学与技术学院,天津,300072);宫秀军,汤莉,GONG Xiu-jun,TANG Li(天津大学计算机科学与技术学院,天津,300072) |
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| 基金项目： | 天津市应用基础及前沿技术研究计划重点资助项目 |
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| 摘 要： | 为构建基因调控网络,提出了一个基于时序互信息学习动态贝叶斯网络结构的学习算法.在计算基因间的时序互信息时,该算法考虑了时间序列微阵列数据的时间特性,并利用协方差矩阵计算互信息,没有将基因表达数据离散化,与基因表达数据的连续性相符合.在酵母菌周期细胞的实验数据上测试该算法,灵敏度为66.7%;该算法构建的基因调控网络与KEGG数据库中的网络相比较,发现了Cdc28与Cdc20、Chk1与Rad9的调控关系,这些调控关系在相应的生物学实验中得到验证.
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| 关 键 词： | 基因调控网络 动态贝叶斯网络 时序互信息 |
Constructing Gene Regulation Network Based on Time Series Mutual Information |
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| GOU Kui-xiang,GONG Xiu-jun,TANG Li.Constructing Gene Regulation Network Based on Time Series Mutual Information[J].Journal of Tianjin University(Science and Technology),2010(7). |
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| Authors: | GOU Kui-xiang GONG Xiu-jun TANG Li |
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