斯卑尔脱小麦Vp-1B基因的等位变异鉴定和序列分析 |
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作者姓名: | 曲若端 杨燕 孟建宇 李淑芬 赵宏斌 |
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作者单位: | 内蒙古农业大学生命科学学院 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(31160247,31260320);内蒙古农业大学科技创新团队基金项目(ND-PYTD2010-3);国家春晖项目计划(Z2009-1-01060) |
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摘 要: | 斯卑尔脱小麦是小麦的一级基因源.在影响小麦穗发芽的众多基因中,Vp-1是调节胚发育,促进胚成熟和休眠的主要转录调节因子.本研究通过同源克隆测序的方法分析了4种不同基因型斯卑尔脱小麦品种Vp-1基因在3B染色体上的等位变异,进一步分析了Vp-1基因在斯卑尔脱小麦和六倍体普通小麦中的差异.研究表明不同休眠特性的4份斯卑尔脱小麦Spelta80,Spelta220,Spelta217和Spelta225在3B染色体的Vp-1B基因上存在大量的等位变异,主要集中在Vp-1B基因的第三和第五内含子中,表现为一些大片段的序列缺失,另外的变异位于Vp-1B基因的第一外显子区和第六外显子区的SNP位点,引起了氨基酸的改变.根据测得的正反向序列重叠部分判断其准确性并拼接全长,命名了斯卑尔脱小麦中存在的三种等位变异,分别为SVp-1Bc(第三内含子中缺失83bp)、SVp-1Bd(第三内含子中缺失25bp)和SVp-1Be(第五内含子中缺失10bp).从斯卑尔脱小麦与六倍体普通小麦的亲缘关系来看,斯卑尔脱小麦中存在的Vp-1B基因的等位变异极有可能也与其休眠特性相关.
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关 键 词: | 穗发芽 斯卑尔脱小麦 Vp-1B 等位变异 |
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