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赤点石斑鱼MHC IA基因的克隆与表达多态性分析
引用本文:沈铭辉,郑乐云,杜佳莹,王军.赤点石斑鱼MHC IA基因的克隆与表达多态性分析[J].厦门大学学报(自然科学版),2013(1):103-108.
作者姓名:沈铭辉  郑乐云  杜佳莹  王军
作者单位:厦门大学海洋与地球学院;福建省水产研究所
基金项目:福建省种业创新与产业化工程项目(闽种石斑004号)
摘    要:采用RACE技术,成功克隆获得赤点石斑鱼(Epinephelus akaara)非特异性免疫因子MHC IA基因的4个cDNA全序列,序列全长为1 680bp,含有3′UTR、启动子、多肽结合区(α1)、IGC区(α2)、跨膜区、胞质区和5′UTR区,编码区大小为1 074~1 080bp,共编码357~359个氨基酸,推测蛋白质分子质量约41.66ku.氨基酸序列分析发现赤点石斑鱼MHC IA分子具有经典MHC蛋白分子的空间结构,在多肽结合区则存在极其丰富的变异.利用Real time PCR和SSCP技术研究了赤点石斑鱼MHC IA的组织表达特异性和表达多态性,发现其在头肾、心、肝等12个组织器官中均能有效表达,在头肾,脾,胸腺等免疫组织表达量不仅高,表达多态性也异常丰富,而在与外界环境接触较多的鳃、肌肉、肠等组织表达较弱.此外,根据MHC IIB分子中相对保守的IGC区氨基酸序列构建了脊椎动物的系统进化树,也表明了该分子的IGC区氨基酸序列可以作为研究鱼类物种间进化关系的良好标记.

关 键 词:赤点石斑鱼  MHC  IA基因  多态性

Cloning and Polymorphism of MHC Class IA Gene from Epinephelus akaara
SHEN Ming-hui,ZHENG Le-yun,DU Jia-ying,WANG Jun.Cloning and Polymorphism of MHC Class IA Gene from Epinephelus akaara[J].Journal of Xiamen University(Natural Science),2013(1):103-108.
Authors:SHEN Ming-hui  ZHENG Le-yun  DU Jia-ying  WANG Jun
Institution:1 (1.College of Ocean&Earth Sciences,Xiamen University,Xiamen 361005,China; 2.Fishery Research Institute of Fujian,Xiamen 361013,China)
Abstract:
Keywords:
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