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基于隐马尔科夫模型的基因预测算法
引用本文:马宝山,朱义胜. 基于隐马尔科夫模型的基因预测算法[J]. 大连海事大学学报(自然科学版), 2008, 34(4): 41-44
作者姓名:马宝山  朱义胜
作者单位:大连海事大学,信息科学技术学院,辽宁,大连,116026;大连海事大学,信息科学技术学院,辽宁,大连,116026
基金项目:国家重点基础研究发展计划(973计划) , 国家自然科学基金  
摘    要:为更好地从DNA序列中识别蛋白质编码区,提高计算效率,将隐马尔科夫模型与前向算法相结合,提出一种生物基因的预测算法.理论证明,该隐马尔科夫模型与经过EM算法优化后的模型具有相同的参数,能够降低计算量,提高计算效率.利用该方法对DNA序列F56F11.4a的外显子进行识别的仿真结果表明,该算法是有效的.

关 键 词:基因识别  隐马尔科夫模型  前向算法  EM算法

Gene-prediction algorithm based on hidden Markov model
MA Bao-shan,ZHU Yi-sheng. Gene-prediction algorithm based on hidden Markov model[J]. Journal of Dalian Maritime University, 2008, 34(4): 41-44
Authors:MA Bao-shan  ZHU Yi-sheng
Abstract:
Keywords:
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