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APOBEC3家族蛋白的进化分析和3D结构比对分析
引用本文:顾卫国,吴宏宇,劳亭嘉,黄青山.APOBEC3家族蛋白的进化分析和3D结构比对分析[J].复旦学报(自然科学版),2008,47(5).
作者姓名:顾卫国  吴宏宇  劳亭嘉  黄青山
作者单位:1. 复旦大学,生命科学学院,遗传学研究所,遗传工程国家重点实验室,上海,200433
2. 上海高科联合生物技术研发有限公司,上海,201206
3. 复旦大学,生命科学学院,遗传学研究所,遗传工程国家重点实验室,上海,200433;上海高科联合生物技术研发有限公司,上海,201206
摘    要:为探寻HIV-1的种间传播路线与范畴进而发现有效的控制物,选取灵长类天然抗病毒因子APOBEC3家族的22种蛋白(以A3G为主)与17例灵长类线粒体(mtDNA)全基因组序列做进化分析研究.结果一致显示除黑猩猩(Pan troglodytes troglodytes,以下简称Pan),大猩猩(Gorilla)以外,猩猩(Pongo)中的某些种也可能是HIV/SIV的贮主或宿主,值得从实践中有目的追溯.不同种属A3G蛋白活性位点与Zn^2+结合位点的3D结构比较结果显示人与其他灵长类物种极为相似,预示着A3G蛋白在结构和功能上是非常保守的.人的APOBEC3蛋白有A~H7种,对它们的活性位点和Zn^2+结合位点进行3D比较,hA3B与hA3G的重合度最好,hA3B不会被HIV-i的Vif作用与降解,提示进一步探讨hA3B的结构与功能对于控制HIV-1的感染与传播很重要.

关 键 词:HIV-1  SIV  APOBEC3家族蛋白  mtDNA贮主  进化分析

Analysis of Phylogeny and 3D Structure of APOBEC3 Family Proteins
GU Wei-guo,WU Hong-yu,LAO Ting-jia,HUANG Qing-shan.Analysis of Phylogeny and 3D Structure of APOBEC3 Family Proteins[J].Journal of Fudan University(Natural Science),2008,47(5).
Authors:GU Wei-guo  WU Hong-yu  LAO Ting-jia  HUANG Qing-shan
Abstract:
Keywords:HIV-1  SIV  mtDNA
本文献已被 维普 万方数据 等数据库收录!
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