胃癌耐药相关hsa-miR-194-5p的靶基因预测及生物信息学分析 |
| |
引用本文: | 李洋,霍生东.胃癌耐药相关hsa-miR-194-5p的靶基因预测及生物信息学分析[J].西北民族学院学报,2023(2):45-53. |
| |
作者姓名: | 李洋 霍生东 |
| |
作者单位: | 西北民族大学生命科学与工程学院 |
| |
基金项目: | 中央高校基本科研业务费专项资金资助项目(31920190204); |
| |
摘 要: | 目的:研究胃癌耐药相关hsa-miR-194-5p的靶基因,并分析其参与的生物学过程和信号转导通路,为胃癌耐药机制的表观遗传学研究提供前期基础.方法:通过NCBI数据库检索hsa-miR-194-5p的基本信息;使用预测数据库预测hsa-miR-194-5p的靶基因;使用DAVID数据库对靶基因集合进行功能富集分析(GO)和信号转导通路富集分析(KEGG).结果:成熟的miR-194-5p序列多个物种之间具有高度保守性.预测靶基因共325个,参与的生物学过程主要有Golgi组织和细胞对DNA损伤刺激的反应(P<0.01),分子功能包括泛素蛋白连接酶结合和泛素介导的蛋白水解(P<0.01),细胞组分富集在细胞核和细胞表面,调控包括TGF-β和WNT等多条信号转导通路(P<0.01).结论:miR-194-5p的靶基因SMURF1、 RAC1、MAPK1与胃癌细胞的增殖密切相关.
|
关 键 词: | hsa-miR-194-5p 靶基因 胃癌耐药 生物信息学 |
|