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胃癌耐药相关hsa-miR-194-5p的靶基因预测及生物信息学分析
引用本文:李洋,霍生东.胃癌耐药相关hsa-miR-194-5p的靶基因预测及生物信息学分析[J].西北民族学院学报,2023(2):45-53.
作者姓名:李洋  霍生东
作者单位:西北民族大学生命科学与工程学院
基金项目:中央高校基本科研业务费专项资金资助项目(31920190204);
摘    要:目的:研究胃癌耐药相关hsa-miR-194-5p的靶基因,并分析其参与的生物学过程和信号转导通路,为胃癌耐药机制的表观遗传学研究提供前期基础.方法:通过NCBI数据库检索hsa-miR-194-5p的基本信息;使用预测数据库预测hsa-miR-194-5p的靶基因;使用DAVID数据库对靶基因集合进行功能富集分析(GO)和信号转导通路富集分析(KEGG).结果:成熟的miR-194-5p序列多个物种之间具有高度保守性.预测靶基因共325个,参与的生物学过程主要有Golgi组织和细胞对DNA损伤刺激的反应(P<0.01),分子功能包括泛素蛋白连接酶结合和泛素介导的蛋白水解(P<0.01),细胞组分富集在细胞核和细胞表面,调控包括TGF-β和WNT等多条信号转导通路(P<0.01).结论:miR-194-5p的靶基因SMURF1、 RAC1、MAPK1与胃癌细胞的增殖密切相关.

关 键 词:hsa-miR-194-5p  靶基因  胃癌耐药  生物信息学
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