| 水稻mRNA多聚腺苷化信号位点的序列分析 |
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| 作者姓名： | 陆颖 高晨曦 韩斌 |
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| 作者单位： | 中国科学院上海生命科学研究院国家基因研究中心,上海,200233;中国科学院研究生院,北京,100039;中国科学院上海生命科学研究院国家基因研究中心,上海,200233;中国科学院研究生院,北京,100039;中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所,上海,200032;中国科学院上海生命科学研究院国家基因研究中心,上海,200233;中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所,上海,200032 |
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| 基金项目： | 致谢 本工作为国家高技术研究发展计划（批准号：2002AA221003）中国科学院和上海市科学技术委员会（批准号：038019315）资助项目. |
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| 摘 要： | 大部分真核生物mRNA的加工涉及到mRNA前体的分裂/多聚腺苷化, 在3′-末端形成多聚腺苷酸(poly(A))尾巴. 为了研究水稻mRNA前体多聚腺苷化过程所必需的poly(A)加尾信号、下游调控元件和poly(A)位点等序列的特点, 用3′-末端带有poly(A) 的EST与全长cDNA序列进行比较, 建立了一个来自9953个基因的、覆盖12969条poly(A)位点两侧各40碱基序列的数据库. 结果发现, 只有7.9%的mRNA使用AAUAAA作为加尾信号, 超过60%使用AAUAAA的1~2个碱基变化的序列作为加尾信号, 11.5%的mRNA使用AAUGAA及其单碱基变化的加尾信号. 在约25%的mRNA的3′-末端存在多个poly(A)位点. 在90%的mRNA前体的加尾信号下游都能检测到富含U/GU的调控元件, 尤其在以AAUAAA的多碱基变化序列作为加尾信号的mRNA前体中, 半数以上都能在poly(A)位点两侧检测到下游调控元件. 而且, 这些调控元件的位置对poly(A)位点的选择有限制作用. 总之, 虽然水稻mRNA加尾信号的保守性较低, 但大量下游调控元件的存在保证了多聚腺苷化过程的正常进行.
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| 关 键 词： | 水稻 表达序列 RNA剪接 多聚腺苷化 |
| 收稿时间： | 2006-01-17 |
| 修稿时间： | 2006-01-172006-02-16 |
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