| 逐步预测和统计学筛选人H5N1毒株神经氨酸酶蛋白B细胞表位 |
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| 引用本文： | 黄平,俞守义,柯昌文.逐步预测和统计学筛选人H5N1毒株神经氨酸酶蛋白B细胞表位[J].科学通报,2008,53(22):2748-2753. |
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| 作者姓名： | 黄平 俞守义 柯昌文 |
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| 作者单位： | ① 广东省疾病预防控制中心, 广东省应急病原学检测重点实验室, 广州 510300;
② 南方医科大学流行病学系, 广州 510515;
③ 世界卫生组织新发传染病监测、研究和培训合作中心, 广州 510300 |
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| 基金项目： | 广东省科技项目(批准号: 2004A2090102)资助 |
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| 摘 要： | 为了预测和筛选人禽流感H5N1毒株神经氨酸酶(NA)蛋白的B细胞表位, 检测了人禽流感H5N1毒株NA基因核苷酸序列. 采用Kyte-Doolittle的亲水性方案、Emini方案和Jameson-Wolf抗原指数方案, 辅以对NA蛋白的二级结构中的柔性区域的分析, 并用SPSS 13.0进行聚类和相关分析, 建立了一种统计学筛选程序, 预测了H5N1病毒NA蛋白的B细胞表位, 并对毒株GD-01-06的NA蛋白变异进行了分析. 预测结果通过吴氏抗原指数和SWISS-MODEL软件进行评价. 结果发现, 预测并筛选最有可能的B细胞表位位于NA蛋白N端第120~137, 81~84, 408~415, 273~282, 429~432, 356~368, 46~55, 146~155, 341~350, 198~209肽段, 提示它们是B细胞表位的优势区段; 含有糖基化位点NGT126~128的120~137肽段为首选的NA蛋白抗原表位; H5N1毒株NA蛋白第53位(Ⅰ)位点缺失, 这有助于增加毒株GD-01-06的NA蛋白表面柔性, 而且抗原表位扩大(VEP46~48→VEPISNTNFL46~55). 采用SWISS-MODEL软件建立的N1蛋白模型有助于评价抗原表位预测. 结果表明, 用多参数预测以及用统计学筛选H5N1毒株NA蛋白的B细胞表位, 可以为分子免疫学研究和药物筛选提供依据; 广东GD-01-06毒株NA蛋白53位(Ⅰ)位点缺失可能增强该抗原表位的抗原性.
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| 关 键 词： | H5N1病毒 神经氨酸酶(NA) B细胞表位 预测 筛选 |
| 收稿时间： | 2008-05-23 |
| 修稿时间： | 2008-09-11 |
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