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六种核酸提取试剂盒对粪样中小鼠肝炎病毒核酸 提取效率的比较
引用本文:桂飞,杨伟伟,俞利平,戴方伟,杜江涛,宋晓明.六种核酸提取试剂盒对粪样中小鼠肝炎病毒核酸 提取效率的比较[J].实验动物科学,2019,36(1):31-35.
作者姓名:桂飞  杨伟伟  俞利平  戴方伟  杜江涛  宋晓明
作者单位:杭州师范大学实验动物中心;浙江省医学科学院实验动物中心
基金项目:浙江省科技计划项目(No.2015C37107;2016C37106);杭州市重大科技专项(No.20142013A62)
摘    要:目的 比较六种商品化试剂盒在小鼠粪便中提取小鼠肝炎病毒(MHV)RNA的效率,筛选出效率高、耗时短的核酸提取方法。方法 采集感染MHV小鼠的新鲜粪便样本,分别用液氮研磨法、磁珠匀浆法以及PBS溶解离心法进行处理,通过同一核酸提取试剂盒比较病毒核酸提取效率,明确最佳样本前处理方法;之后,用6种试剂盒进行RNA提取,经反转录后进行TaqMan实时定量PCR检测,以Ct值评价6种试剂盒的提取效率,结合产物测序和血清抗体ELISA结果,筛选MHV的最佳核酸提取方法。结果 对于粪便样本的前处理,液氮研磨法的RNA提取效率显著高于磁珠匀浆法。对于6种试剂盒的提取效果,TIANGEN DP422总RNA浓度:(549.70±52.38) ng/μL,Ct值:(24.51±0.10)]核酸提取效率最高;TIANGEN SD101总RNA浓度:(274.13±6.87) ng/μL,Ct值:(2.39±0.017)]和QIAGEN 52904总RNA浓度:(288.13±15.11) ng/μL,Ct值:(2.40±0.012)]用时最短;XS VRL总RNA浓度:(348.80±15.85) ng/μL,Ct值:(24.70±0.13)]操作最为方便。结论 粪便样本前处理建议采用液氮研磨法。针对粪便中MHV RNA的提取,TIANGEN DP422提取效率最高,推荐用于小鼠肝炎病毒的分子生物学检测。

关 键 词:小鼠肝炎病毒  病毒RNA提取  TaqMan探针  实时荧光定量PCR  

Comparation of Six Nucleic Acid Extraction Kits in the Extraction Efficiecy of Hepatitis Virus Nucleic Acid in Fecal Samples
GUI Fei,YANG Weiwei,YU Lipin,DAI Fangwei,DU Jiangtao,SONG Xiaoming.Comparation of Six Nucleic Acid Extraction Kits in the Extraction Efficiecy of Hepatitis Virus Nucleic Acid in Fecal Samples[J].Shiyan Dongwu Kexue,2019,36(1):31-35.
Authors:GUI Fei  YANG Weiwei  YU Lipin  DAI Fangwei  DU Jiangtao  SONG Xiaoming
Institution:(Center of Laboratory Animals, Hangzhou Normal University , Hangzhou 310036 , China;Center of Laboratory Animals , Zhejiang Academy of Medical Sciences , Hangzhou 310013 , China)
Abstract:GUI Fei;YANG Weiwei;YU Lipin;DAI Fangwei;DU Jiangtao;SONG Xiaoming(Center of Laboratory Animals, Hangzhou Normal University , Hangzhou 310036 , China;Center of Laboratory Animals , Zhejiang Academy of Medical Sciences , Hangzhou 310013 , China)
Keywords:Mouse Hepatitis Virus ( MHV )  viral RNA extraction  TaqMan probe  Real-time fluorescent quantitative PCR
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