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改进的复合区间作图模型及在杨树上的QTL定位
引用本文:刘粉香,童春发,孙勤红.改进的复合区间作图模型及在杨树上的QTL定位[J].科学技术与工程,2016,16(25).
作者姓名:刘粉香  童春发  孙勤红
作者单位:三江学院 南京林业大学,南京林业大学,三江学院
基金项目:国家自然科学基金(31270706)
摘    要:复合区间作图法最先是为近交群体而设计的作图方法。林木F1代群体具有遗传杂合度高,生长周期漫长等特点,很难产生近交系,不能简单的套用适用于近交群体的复合区间作图模型。本文建立了适用于林木全同胞家系的QTL复合区间作图统计模型,运用了“逐步回归法”筛选出最优遗传背景标记。采用Monte Carlo方法模拟全同胞家系中共有6条长100cM的染色体,模拟结果表明,每个QTL的位置和遗传力的计算比较精确。本文利用杨树双亲的SNP分子标记遗传连锁图谱,以及其子代的树高生长性状进行了QTL定位 。当似然比统计量的阀值(对应于 LOD 为3.0)取为11.2时,在母本美洲黑杨的遗传连锁图谱上,有4个 QTL 分布在4个连锁群上 。当似然比统计量的阀值取为 16.5,在父本小叶杨的遗传连锁图谱上, 有 3 个 QTL 分布在3个连锁群上。显示了本文所建复合区间作图统计模型有着明显的QTL作图效力。文中所有的计算都是使用 R语言软件编程完成的。#$NL关键词 复合区间作图,F1代群体,逐步回归法,Monte Carlo

关 键 词:复合区间作图,F1代群体,逐步回归法,Monte  Carlo
收稿时间:4/5/2016 12:00:00 AM
修稿时间:2016/8/19 0:00:00

Improved composite interval mapping model and QTL mapping on Poplar
Liufenxiang,and.Improved composite interval mapping model and QTL mapping on Poplar[J].Science Technology and Engineering,2016,16(25).
Authors:Liufenxiang  and
Abstract:
Keywords:composite  interval mapping  F1 population  stepwise  regression  Monte  Carlo
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