废水处理功能菌株FA-2的实时荧光定量PCR检测 |
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引用本文: | 马欣荣,牟丽娉,夏庆杰,黄钧.废水处理功能菌株FA-2的实时荧光定量PCR检测[J].四川大学学报(自然科学版),2008,45(1):253-257. |
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作者姓名: | 马欣荣 牟丽娉 夏庆杰 黄钧 |
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作者单位: | 中国科学院成都生物研究所;中国科学院成都生物研究所;四川大学华西医院;中国科学院成都生物研究所 |
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基金项目: | “十五”863重大专项课题(2002AA061210);中科院“西部之光”人才培养 |
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摘 要: | FA-2是油脂化工废水处理系统中分离到的降解脂肪酸和脂肪胺的功能菌.本研究以大肠杆菌为参照菌,基于荧光定量PCR技术,建立了检测FA-2相对含量的荧光定量PCR方法.根据FA-2已知特异序列GENE2和大肠杆菌16 s rRNA基因序列GENE1分别设计合成特异引物和Tagman探针,采用实时荧光定量PCR技术分别检测各样本FA-2和E.coli 16 s rRNA基因的相对拷贝数,获得了FA-2及大肠杆菌的标准曲线.并比较这两种基因剂量之比例和混和的菌数比例之间的关系.结果表明混合菌液中FA-2的含量与CtGENE2与CtGENE1的差值ΔCt呈线性关系,由此可以推算出模板DNA的数量及对应的细菌数量.荧光定量检测结果与直接计数结果基本一致.该方法的建立,为进一步在废水处理系统中应用FQ-CR检测功能菌的含量打下基础.
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关 键 词: | 功能菌FA-2 大肠杆菌 实时荧光定量PCR(FQ-PCR) |
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