| 人类肾脏组织特异性蛋白网络构建及分析 |
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| 引用本文： | 张小驰,宫秀军. 人类肾脏组织特异性蛋白网络构建及分析[J]. 广西大学学报(自然科学版), 2013, 0(5) |
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| 作者姓名： | 张小驰 宫秀军 |
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| 作者单位： | 天津大学 计算机科学与技术学院，天津 300072; 天津市认知计算与应用重点实验室，天津 300072 |
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| 基金项目： | 国家自然基金资助项目(61170177)；国家973项目 |
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| 摘 要： | 生命体内组织特异性基因往往在对应的组织中表现出高的共表达性，在组织特异性基因的调控中，非组织特异性的转录因子往往起很大作用，并且这些转录因子往往与特定的转录因子一起影响组织的特异性，因此研究组织特异性基因编码蛋白相互作用网络必须考虑非组织特异性蛋白的影响。本文提出了一种利用最短路径算法来计算组织特异性基因编码蛋白的关联蛋白，从而构建最大连接强度的组织特异性蛋白相互作用网络，并对其拓扑结构进行基因本体（ GO）、KEGG Pathway和疾病本体（ DO）的富集度分析。通过对肾脏组织中的1486个蛋白质及其相应的4011条蛋白质相互作用分析，发现绝大部分结构的功能与肾脏组织的功相吻合，同时也发现了几种比较有趣的表面上与肾脏组织无关的功能及疾病。
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| 关 键 词： | 组织特异性 蛋白质相互作用网络 肾脏 最短路径 富集度分析 |
Interaction network construction and enrichment analysis for human kidney tissue specific proteins |
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| ZHANG Xiao-chi , GONG Xiu-jun. Interaction network construction and enrichment analysis for human kidney tissue specific proteins[J]. Journal of Guangxi University(Natural Science Edition), 2013, 0(5) |
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| Authors: | ZHANG Xiao-chi GONG Xiu-jun |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | tissue specific protein interaction networks kidney shortest pat enrichment analyis |
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