嗜麦芽糖寡氧单胞菌H002的基因组分析及对铀胁迫的转录组响应 |
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引用本文: | 唐婷,李汶晋,李睿,冯红.嗜麦芽糖寡氧单胞菌H002的基因组分析及对铀胁迫的转录组响应[J].四川大学学报(自然科学版),2023,60(6):066003-226. |
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作者姓名: | 唐婷 李汶晋 李睿 冯红 |
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作者单位: | 四川大学生命科学学院 四川省分子生物学与生物技术重点实验室,四川大学生命科学学院 四川省分子生物学与生物技术重点实验室,四川大学生命科学学院 四川省分子生物学与生物技术重点实验室,四川大学生命科学学院 四川省分子生物学与生物技术重点实验室 |
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基金项目: | 四川省辐射诱变技术育种平台项目(2021YFYZ0011) |
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摘 要: | 为探究嗜麦芽糖寡氧单胞菌H002响应金属铀冲击的分子机制及生物修复铀污染的潜力,本研究从基因组和转录组两个层面进行了分析.基因组测序结果表明,H002基因组大小为5 099 056 bp,预测编码4780个蛋白;与其他6个近缘菌株相比,H002拥有344个独特的编码基因,涉及膜转运、细胞运动和分泌等功能.转录组分析显示,在铀胁迫的早期(1 h),差异基因主要富集于细胞运动、分泌、蛋白质和肽聚糖合成等KEGG途径.部分分泌通道相关基因的表达下调,可降低细胞对铀离子的摄取,进而减轻铀离子对细胞的毒性.在铀胁迫的后期(2 h和4 h),参与铀生物矿化的磷酸酶相关基因和能够提供还原电子的细胞色素c基因的表达上调,能以主动方式降低铀的细胞毒性.
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关 键 词: | 嗜麦芽糖寡氧单胞菌 铀 基因组 转录组学 生物修复 |
收稿时间: | 2022/12/15 0:00:00 |
修稿时间: | 2023/4/1 0:00:00 |
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