| 基于GASpy的材料模拟计算框架 |
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| 引用本文： | 阳王东,杨昊,冷灿,?,潘佳铭,唐卓,田泽安,李肯立. 基于GASpy的材料模拟计算框架[J]. 湖南大学学报(自然科学版), 2022, 49(2): 93-100. DOI: 10.16339/j.cnki.hdxbzkb.2022263 |
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| 作者姓名： | 阳王东 杨昊 冷灿 ? 潘佳铭 唐卓 田泽安 李肯立 |
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| 作者单位： | 湖南大学信息科学与工程学院,湖南长沙410082;国防科技大学计算机学院,湖南长沙410073;国家超级计算长沙中心,湖南长沙410082 |
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| 摘 要： | 随着信息学和数据科学工具的发展,各种计算机科学软件在材料模拟计算领域的应用不断增加.为了加速催化剂的筛选,开展了基于信息工具如何改善和增强材料筛选的研究,介绍一种基于第一性原理的高通量材料集成计算框架GASpy(Generalized Adsorption Simu?lator for Python).该框架支持计算任务的自动化流程管理,可以借助Fireworks调用DFT(Den?sity Functional Theory)计算,并可以将运算结果以及中间步骤保存至MongoDB数据库.平台支持与不同高性能计算集群的动态绑定,支持大批量计算作业的生成、提交.平台同时支持数据的提取、自动存储.利用GASpy在天河一号上对材料网站上获取的晶体结构进行了实验测试,进行晶体结构优化并计算吸附能,结果表明结合各种信息学工具可以更加灵活高效地实现大规模自动化的DFT材料模拟计算,在模拟电催化领域有较好的应用前景.
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| 关 键 词： | GASpy 第一性原理 高通量框架 DFT 材料模拟计算 |
Material Simulation Calculation Framework Based on GASpy |
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| YANG Wangdong,YANG Hao,LENG Can,?,PAN Jiaming,TANG Zhuo,TIAN Zean,LI Kenli. Material Simulation Calculation Framework Based on GASpy[J]. Journal of Hunan University(Naturnal Science), 2022, 49(2): 93-100. DOI: 10.16339/j.cnki.hdxbzkb.2022263 |
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| Authors: | YANG Wangdong YANG Hao LENG Can ? PAN Jiaming TANG Zhuo TIAN Zean LI Kenli |
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